典型文献
锌指蛋白基因ZMYM2来源环状RNA hsa_circ_0029625的特征分析和功能预测
文献摘要：
目的 环状RNA(circRNA)在多种生理病理过程中均发挥重要作用,但仍有许多circRNAs的功能尚待发掘,文章旨在研究锌指蛋白基因ZMYM2转录形成的环状RNA hsa_circ_0029625的主要特征,并对其进行功能预测和初步探究.方法 从反向剪接位点及全长测序验证、核糖核酸酶R(RNase R)抵抗实验(细胞样本分为RNase R组和对照组)、细胞核质RNA分离实验、翻译蛋白潜能四个方面探究该circRNA的基本特征.利用荧光实时定量PCR实验初步探究该circRNA在胃癌中的表达.通过生物信息学预测circRNA上潜在结合的微小RNA(miRNA),并应用基因本体论(GO)对下游靶基因进行功能注释,初步验证下游靶基因,筛选和分析下游关键基因.结果 hsa_circ_0029625是由ZMYM2转录本NM_003453反向剪接形成,全长测序比对结果符合预期.hsa_circ_0029625可耐受RNase R,主要位于细胞质.蛋白翻译分析显示:hsa_circ_0029625可能编码多肽.RNA定量分析显示:该circRNA在胃癌组织中较癌旁组织明显下调.荧光实时定量PCR实验验证5个下游靶基因在胃癌组织中表达下调.GO功能注释显示:靶基因主要涉及转录等生物过程以及转录调节活性等分子功能.结论 锌指蛋白基因ZMYM2来源环状RNA hsa_circ_0029625具有环状RNA的基本特征,有编码多肽潜能,可能通过海绵miRNAs参与多种生物学过程及功能,在胃癌样本中低表达及生物信息学预测提示其可作为胃癌潜在靶点.
文献关键词：
ZMYM2;环状RNA;翻译蛋白潜能;miRNA;功能预测;胃癌
中图分类号：
作者姓名：
林铭珍;周新科;姚文霞;潘劲辉;董志杰;王知源;肖瑶;黄伟;梁敏
作者机构：
510700 广州,广州医科大学附属第五医院肿瘤科
文献出处：
引用格式：
[1]林铭珍;周新科;姚文霞;潘劲辉;董志杰;王知源;肖瑶;黄伟;梁敏-.锌指蛋白基因ZMYM2来源环状RNA hsa_circ_0029625的特征分析和功能预测)[J].医学研究与战创伤救治,2022(06):581-591
A类：
ZMYM2,翻译蛋白潜能
B类：
锌指蛋白,hsa,功能预测,生理病理,病理过程,circRNAs,尚待,待发,反向剪接,全长,核糖核酸,核酸酶,RNase,细胞样本,细胞核,核质,实时定量,基因本体论,靶基因,功能注释,关键基因,转录本,NM,细胞质,蛋白翻译,翻译分析,多肽,胃癌组织,癌旁组织,组织中表达,生物过程,转录调节,miRNAs,生物学过程,低表达,潜在靶点
AB值：
0.248684
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