典型文献
基于数据库构建乳腺癌焦亡相关基因的预后风险模型
文献摘要：
目的 探究焦亡相关差异表达基因(DEGs)在乳腺癌中预后价值并构建预后风险模型.方法 从癌症基因组图谱(TCGA)和肿瘤基因表达数据库(GEO)官网下载乳腺癌的基因测序、临床数据,筛选焦亡相关DEGs.将乳腺癌患者进行聚类分析.在TCGA队列中以最小绝对收缩和选择算子(LASSO)方法建立模型.利用Kaplan-Meier生存曲线、受试者工作特征曲线(ROC)、单因素及多因素Cox回归独立预后因素分析等评价该模型.GEO队列为验证集.通过GO、KEGG、ssGSEA分析风险DEGs的富集情况.结果 筛选出焦亡相关DEGs,聚类分析可见C2组总生存期(OS)延长,差异有统计学意义(P=0.020).该模型K-M生存分析显示,高风险组OS缩短(TCGA队列中P<0.001,GEO队列中P=0.018).ROC曲线下面积(AUC)表明该模型具有一定预测能力.单因素、多因素Cox回归分析表明,年龄,M、N分期和风险评分为OS的独立预测因子.GO、KEGG富集与ssGSEA分析证实了风险相关DEGs与免疫炎症因子和通路有关.结论 研究构建了由9个焦亡相关基因组成的乳腺癌预后风险模型,为乳腺癌患者的风险预后评估提供了参考.
文献关键词：
乳腺癌;焦亡;免疫;预后;预测模型
中图分类号：
作者姓名：
贺士卿;李皖皖;董书晴;牟婧怡;刘宇莹;魏思雨;刘钊;张家新
作者机构：
徐州医科大学附属医院甲乳外科,江苏 徐州221004
文献出处：
引用格式：
[1]贺士卿;李皖皖;董书晴;牟婧怡;刘宇莹;魏思雨;刘钊;张家新-.基于数据库构建乳腺癌焦亡相关基因的预后风险模型)[J].山东大学学报（医学版）,2022(08):34-43
A类：
B类：
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AB值：
0.298398
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