典型文献
盐胁迫下拟南芥去乙酰化酶基因的转录组分析
文献摘要：
为了探究盐胁迫下拟南芥HD2去乙酰化酶调控的下游基因,本研究以拟南芥野生型WT和四突(hd2q,HD2四个基因的突变体)为材料,采用RNA-seq技术和生物信息学方法,对生长10d的幼苗在高盐(150mmol/LNaCl)处理前和后进行比较转录组分析,并结合实时荧光定量PCR验证转录组数据的可靠性.结果显示:在高盐处理前WT和hd2q共有25个差异基因,其中上调基因2个,下调基因23个.在高盐处理后,WT和hd2q共有1407个差异基因,其中上调基因772个,下调基因635个.GO和KEGG分析显示,对照组的差异基因主要富集在胞外区域和响应脱落酸上,盐处理组的差异基因主要富集在胞外区域和细胞壁上,并且发现有41个与盐响应途径相关的差异基因(27个上调基因,14个下调基因).结果表明拟南芥HD2去乙酰化酶调控下游盐响应基因从而使拟南芥适应盐胁迫环境.
文献关键词：
拟南芥;幼苗;转录组;盐处理;HD2去乙酰化酶
中图分类号：
作者姓名：
欧艺鹏;黄轩雅;陈功春;林娟
作者机构：
复旦大学生命科学学院遗传工程国家重点实验室,上海200438
文献出处：
引用格式：
[1]欧艺鹏;黄轩雅;陈功春;林娟-.盐胁迫下拟南芥去乙酰化酶基因的转录组分析)[J].四川大学学报（自然科学版）,2022(01):180-188
A类：
hd2q
B类：
盐胁迫,拟南芥,去乙酰化酶,酶基因,HD2,野生型,WT,突变体,seq,生物信息学方法,10d,幼苗,高盐,150mmol,LNaCl,比较转录组分析,转录组数据,盐处理,差异基因,胞外区,外区域,脱落酸,细胞壁,壁上,响应基因,胁迫环境
AB值：
0.245096
相似文献
机标中图分类号，由域田数据科技根据网络公开资料自动分析生成，仅供学习研究参考。
