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水稻种子耐贮性全基因组关联分析
文献摘要：
水稻(Oryza sativa)种子耐贮性是粮食安全和用种安全的重要保障,发掘水稻种子耐贮性QTL位点并筛选优异的耐贮单倍型是水稻耐贮性遗传改良的基础.本研究以431份来自全球3000份水稻(3K水稻)资源的核心种质为研究材料,2019和2020年分别在湖南长沙和海南三亚进行分期播种,使得各试验材料成熟期基本保持一致.收获的种子经自然贮藏和人工老化处理后进行耐贮性鉴定,结合基因型数据进行水稻种子耐贮性全基因组关联分析(genome wide association study,GWAS),以P<1×10-4为阈值,重复检测到14个耐贮性QTL位点,分布在水稻2、3、5、8、9、10、11和12号染色体上,解释的表型变异为5％～24％,qSS3-2和qSS5-2为新QTL.在这14个QTL区间内共挖掘到17个与水稻种子耐贮性相关的候选基因,对qSS5-2区间内的候选基因进行单倍型分析,鉴定到了8种水稻种子耐贮单倍型.本研究结果为水稻耐贮性遗传改良提供理论参考与重要基因资源.
文献关键词：
水稻;种子耐贮性;全基因组关联分析(GWAS);QTL
中图分类号：
作者姓名：
何兮;闫蕴韬;桂金鑫;李彬燕;莫茜;吴心成;张海清;贺记外
作者机构：
湖南农业大学农学院,长沙410128
文献出处：
引用格式：
[1]何兮;闫蕴韬;桂金鑫;李彬燕;莫茜;吴心成;张海清;贺记外-.水稻种子耐贮性全基因组关联分析)[J].农业生物技术学报,2022(09):1662-1675
A类：
种子耐贮性,qSS3,qSS5
B类：
水稻种子,全基因组关联分析,Oryza,sativa,用种安全,QTL,选优,遗传改良,3K,核心种质,湖南长沙,三亚,分期播种,各试,成熟期,保持一致,贮藏,人工老化,老化处理,基因型,genome,wide,association,study,GWAS,重复检测,表型变异,候选基因,单倍型分析,基因资源
AB值：
0.224134
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