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典型文献
利用SSR创建中国北方黍稷资源DNA身份证
文献摘要:
利用SSR标记,分析中国北方黍稷种质资源的区别与联系,根据DNA碱基的不同,制作出不同的DNA身份证,即构建字符串DNA分子身份证、条形码DNA分子身份证和二维码DNA分子身份证,为黍稷资源管理和保护提供依据.用14对高基元SSR(六碱基4对、五碱基10对)引物对8个省共20份黍稷资源进行分子身份证的构建,利用PowerMarker 3.25、PopGen 1.32软件计算遗传多样性参数,利用ID Analysis 4.0进行引物组合优化.结果表明,20份材料在10个位点共检测出等位变异10个;Shannon多样性指数(I)为0.7029(RYW7)~1.0880(RYW2),平均为0.9588;观测杂合度(Ho)为0.5000(RYW7)~0.8235(RYW12),平均为0.6866;有效等位变异(Ne)为1.6623(RYW7)~2.7923(RYW12),平均为2.4553;期望观测杂合度(He)为0.4113(RYW7)~0.6862(RYW2),平均为0.6024;多态性信息含量(PIC)为0.4886(RYW3)~0.7766(RYW8),平均为0.6298;Nei's基因多样性指数(Nei)为0.3984(RYW7)~0.6598(RYW2),平均为0.5828.
文献关键词:
黍稷;SSR;DNA条形码;DNA二维码;中国北方
作者姓名:
胡玉璐;姜百灵;陈凌;王海岗;曹晓宁;王瑞云;乔治军
作者机构:
山西农业大学 农学院,山西 太谷 030801;山西农业大学 农业基因资源研究中心/农业农村部黄土高原作物基因资源与种质创制重点实验室/杂粮种质资源发掘与遗传改良山西省重点实验室,山西 太原 030031
文献出处:
引用格式:
[1]胡玉璐;姜百灵;陈凌;王海岗;曹晓宁;王瑞云;乔治军-.利用SSR创建中国北方黍稷资源DNA身份证)[J].山西农业科学,2022(04):478-485
A类:
PopGen,RYW2,RYW12
B类:
SSR,中国北方,黍稷,种质资源,区别与联系,碱基,字符串,分子身份证,条形码,二维码,基元,引物,PowerMarker,软件计算,遗传多样性参数,ID,Analysis,组合优化,个位,等位变异,Shannon,多样性指数,RYW7,杂合度,Ho,He,多态性信息含量,PIC,RYW3,RYW8,Nei
AB值:
0.309383
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