首站-论文投稿智能助手
典型文献
基于UHPLC-QTOF-MS/MS和TCMIP的牡丹皮治疗慢性肾炎活性成分筛选及作用机制分析
文献摘要:
目的 基于超高效液相色谱-四极杆飞行时间质谱(ultra-high performance liquid chromatography-quadrupole time of flight mass spectrometry,UHPLC-QTOF-MS/MS)技术和中医药整合药理学研究平台(Chinese Medicine Integrated Pharmacology Research Platform,TCMIP)v2.0筛选牡丹皮治疗慢性肾炎的活性成分,并初步分析其作用机制.方法 采用UHPLC-QTOF-MS/MS,分别在正、负离子扫描模式下对牡丹皮化学成分进行定性分析;基于TCMIPv2.0收集牡丹皮的候选靶标谱和慢性肾炎的基因集;基于TCMIP v2.0平台构建上述靶标间的蛋白间相互作用(protein-protein interaction,PPI)网络,根据网络特征值确定核心靶标;通过DAVID v6.8软件()进行基因本体论(genetic ontology,GO)功能分析和京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)通路富集分析,筛选与慢性肾炎相关的通路作为核心通路;圈定核心通路对应靶标的化学成分,统计每个成分的靶点数量、靶点频次、成分含量;根据统计结果确定牡丹皮治疗慢性肾炎的核心成分;利用Cytoscape3.8.0软件构建"成分-靶标-通路"多维关联网络.结果 在正、负离子模式下共鉴定了牡丹皮中73个化学成分;通过分析PPI相互作用网络获得123个核心节点;KEGG富集分析确定了 17条慢性肾炎相关通路;通过靶点数量、频次和响应值综合筛选得到13个核心成分.结论 牡丹皮中的13个核心成分可能通过调控核因子-κB(nuclear factor-κB,NF-κB)通路、肾素分泌通路、磷脂酰肌醇-3-羟激酶(phosphatidylinositol-3-hydroxykinase,PI3K)/蛋白激酶B(protein kinase B,Akt)通路等17条通路治疗慢性肾炎,为进一步研究牡丹皮治疗慢性肾炎的作用机制奠定了数据基础.
文献关键词:
牡丹皮;慢性肾炎;整合药理学;活性成分;作用机制;UHPLC-QTOF-MS/MS;没食子酸;芍药苷;丹皮酚
作者姓名:
张瞳;秦月雯;王萍;赵能武
作者机构:
贵州中医药大学,贵州贵阳 550025;中国中医科学院中药研究所,北京 100700
文献出处:
引用格式:
[1]张瞳;秦月雯;王萍;赵能武-.基于UHPLC-QTOF-MS/MS和TCMIP的牡丹皮治疗慢性肾炎活性成分筛选及作用机制分析)[J].中草药,2022(09):2756-2767
A类:
TCMIPv2,hydroxykinase
B类:
UHPLC,QTOF,牡丹皮,慢性肾炎,活性成分筛选,机制分析,超高效液相色谱,四极杆飞行时间质谱,ultra,high,performance,liquid,chromatography,quadrupole,flight,mass,spectrometry,整合药理学,药理学研究,研究平台,Chinese,Medicine,Integrated,Pharmacology,Research,Platform,初步分析,负离子,扫描模式,靶标,平台构建,protein,interaction,PPI,网络特征,DAVID,v6,基因本体论,genetic,ontology,功能分析,京都基因与基因组百科全书,Kyoto,encyclopedia,genes,genomes,通路富集分析,心通,圈定,成分含量,核心成分,Cytoscape3,软件构建,多维关联,关联网络,子模式,个化,相互作用网络,核心节点,相关通路,响应值,选得,核因子,nuclear,肾素,磷脂酰肌醇,phosphatidylinositol,PI3K,蛋白激酶,Akt,数据基础,没食子酸,芍药苷,丹皮酚
AB值:
0.334244
相似文献
机标中图分类号,由域田数据科技根据网络公开资料自动分析生成,仅供学习研究参考。