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典型文献
一株万古霉素中介耐药溶血葡萄球菌全基因组测序
文献摘要:
目的 对分离自血液样本的一株万古霉素中介耐药溶血葡萄球菌进行全基因组测序分析,探讨细菌对万古霉素中介耐药的可能机制.方法 通过第三代测序技术对一株万古霉素中介耐药溶血葡萄球菌临床分离株SH-1进行全基因组测序分析,进一步运用Blast对耐药基因和万古霉素耐药相关基因进行分析.VITEK 2 Compact全自动细菌鉴定及药敏分析系统分析SH-1的药物敏感性,E-test法检测SH-1对万古霉素的敏感性.结果 溶血葡萄球菌SH-1对青霉素、苯唑西林、替考拉宁等抗菌药物耐药,对万古霉素中介耐药.E-test检测结果显示SH-1对万古霉素最低抑菌浓度(MIC)值为8 μg/ml.SH-1全基因组大小为2 622 719 bp,GC含量有32.85%,含有2 556个编码序列,63个tRNA编码基因,以及16个rRNA基因编码的操纵子.SH-1属于ST97型耐甲氧西林溶血葡萄球菌,SH-1中有18个基因发生了突变,其中万古霉素耐药相关二元调控系统WalK(N70K)、WalK(R280Q)发生了点突变.结论 通过全基因组测序初步分析了一株溶血葡萄球菌SH-1菌株基因组特征,研究了 SH-1基因突变情况,二元调控系统WalK(N70K)、WalK(R280Q)发生了点突变可能是引起SH-1对万古霉素中介耐药的重要原因.
文献关键词:
溶血葡萄球菌;耐药基因;万古霉素;全基因组测序;二元调控系统;WalK
作者姓名:
杨壁瑕;钟天;林舒楠;唐晓华;吴斌;袁文常
作者机构:
广州医科大学金域检验学院,广东广州510182;广州医科大学附属第三医院检验科,广东广州510150;广州市第一人民医院检验科,广东广州510180
引用格式:
[1]杨壁瑕;钟天;林舒楠;唐晓华;吴斌;袁文常-.一株万古霉素中介耐药溶血葡萄球菌全基因组测序)[J].中华医院感染学杂志,2022(14):2094-2098
A类:
ST97,二元调控系统,WalK,N70K,R280Q
B类:
一株,溶血葡萄球菌,自血,血液样本,全基因组测序分析,可能机制,第三代测序技术,临床分离株,SH,Blast,耐药基因,万古霉素耐药,VITEK,Compact,细菌鉴定,药敏分析,药物敏感性,test,青霉素,西林,替考拉宁,抗菌药物耐药,最低抑菌浓度,MIC,ml,基因组大小,bp,编码序列,tRNA,编码基因,rRNA,基因编码,操纵子,点突变,初步分析,基因组特征,基因突变
AB值:
0.188323
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