典型文献
光叶丁公藤及其3个潜在代用品治疗类风湿性关节炎差异性成分和作用机制研究
文献摘要:
目的 研究光叶丁公藤Erycibe schmidtii与3个潜在代用品多花丁公藤E.myriantha、凹脉丁公藤E.ellptilimba、大果飞蛾藤Porana sinensis治疗类风湿性关节炎(rheumatoid arthritis,RA)的差异性成分和潜在作用机制.方法 采用超高效液相色谱-四极杆/静电场轨道阱高分辨质谱法(UHPLC-Q Exactive Focus MS/MS)分析光叶丁公藤及3个潜在代用品的差异成分;结合Swiss Target Prediction、DisGeNET、OMIM、TTD等数据库获得差异成分治疗RA的作用靶点;采用STRING数据库构建共有靶点互作(protein-protein interaction,PPI)网络模型,采用Cytoscape 3.6.0软件进行可视化处理并分析网络拓扑参数筛选出核心靶点;通过DAVID数据库和R语言软件对靶点进行基因本体(gene ontology,GO)分析和京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)信号通路富集分析,采用Cytoscape 3.6.0软件构建"药材-差异成分-靶点-通路(H-C-T-P)"网络图并进行分析,探讨光叶丁公藤及3个潜在代用品差异成分治疗RA的潜在作用机制.结果 从光叶丁公藤及3个潜在代用品中共鉴定60个成分,其中差异成分35个,共涉及348个靶点.与RA相关的差异成分有18个,得到差异成分-RA共同靶点153个.GO和KEGG富集分析结果显示光叶丁公藤及3个潜在代用品可能通过芒柄花素、丁公藤黄素E、圣草酚、N-反式-对香豆酰酪胺、秦皮乙素共5个活性差异成分作用于RAC-α丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶(RAC-alpha serine/threonine-protein kinase,AKT1)、双特异性丝裂原活化蛋白激酶激酶 1(dual specificity mitogen-activated protein kinase kinase 1,MAP2K1)、磷脂酰肌醇 4,5-二磷酸 3-激酶催化亚单位 α 亚型(phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha isoform,PIK3CA)等 32 个靶点,调节 PI3K-Akt 信号通路、Rap 1 信号通路、Ras信号通路等5个信号通路发挥治疗RA的作用.结论 初步明确了光叶丁公藤及3个潜在代用品治疗RA的差异成分、关键靶点和核心通路;光叶丁公藤和大果飞蛾藤所鉴定的共有化学成分数量和H-C-T-P网络图中度值较其他2个潜在代用品高,说明大果飞蛾藤更适合做光叶丁公藤代用品;为濒危中药代用品开发提供了相对可靠的新策略.
文献关键词:
丁公藤;差异性成分;网络药理学;类风湿性关节炎;多花丁公藤;凹脉丁公藤;大果飞蛾藤;芒柄花素;丁公藤黄素E;圣草酚;N-反式-对香豆酰酪胺;秦皮乙素
中图分类号:
作者姓名:
胡静;杨媛媛;任慧;崔小敏;李宁;曲彤;陈志永
作者机构:
陕西省中医药研究院,陕西西安 710061;西安市食品药品检验所,陕西西安 710054
文献出处:
引用格式:
[1]胡静;杨媛媛;任慧;崔小敏;李宁;曲彤;陈志永-.光叶丁公藤及其3个潜在代用品治疗类风湿性关节炎差异性成分和作用机制研究)[J].中草药,2022(16):4958-4972
A类:
Erycibe,schmidtii,多花丁公藤,myriantha,凹脉丁公藤,ellptilimba,大果飞蛾藤,Porana
B类:
代用品,类风湿性关节炎,差异性成分,sinensis,rheumatoid,arthritis,潜在作用,超高效液相色谱,四极,静电场轨道阱高分辨质谱,高分辨质谱法,UHPLC,Exactive,Focus,差异成分,Swiss,Target,Prediction,DisGeNET,OMIM,TTD,分治,作用靶点,STRING,数据库构建,protein,interaction,PPI,Cytoscape,可视化处理,网络拓扑参数,参数筛选,核心靶点,DAVID,对靶,基因本体,ontology,京都基因与基因组百科全书,Kyoto,encyclopedia,genes,genomes,信号通路富集,通路富集分析,软件构建,网络图,讨光,芒柄花素,藤黄,黄素,圣草酚,反式,酪胺,秦皮乙素,成分作用,RAC,丝氨酸,苏氨酸蛋白激酶,alpha,serine,threonine,kinase,AKT1,丝裂原活化蛋白激酶,dual,specificity,mitogen,activated,MAP2K1,磷脂酰肌醇,二磷酸,酶催化,亚单位,phosphatidylinositol,bisphosphate,catalytic,subunit,isoform,PIK3CA,PI3K,Akt,Rap,Ras,关键靶点,心通,明大,合做,濒危,网络药理学
AB值:
0.284996
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