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典型文献
SSJNMF算法识别基因-药物共模块探讨
文献摘要:
为识别基因-药物共模块,更好地发现抗癌药物作用的分子机理,选择针对既定癌症的潜在药物靶标,在非负矩阵分解算法中加入基因、药物和基因-药物模块的数据信息,提出了SSJNMF算法.将该算法用于癌症药物敏感性基因组学数据集,识别了70个基因-药物共模块,与已发表的两种算法(NetNMF和JNMF)进行比较,结果表明,SSJNMF识别出的共模块具有更强的统计意义和生物意义.
文献关键词:
基因-药物共模块;非负矩阵分解;统计意义;生物意义
作者姓名:
马敬山;毛玉杰;张杉
作者机构:
石家庄邮电职业技术学院,石家庄050022;燕山大学 理学院,河北 秦皇岛066004;中车唐山机车车辆有限公司,河北 唐山063000
文献出处:
引用格式:
[1]马敬山;毛玉杰;张杉-.SSJNMF算法识别基因-药物共模块探讨)[J].黑龙江科学,2022(22):26-28,32
A类:
SSJNMF,NetNMF,JNMF
B类:
算法识别,共模,抗癌药物,药物作用,分子机理,既定,潜在药物,药物靶标,非负矩阵分解,药物敏感性,基因组学,组学数据,统计意义,生物意义
AB值:
0.26762
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