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典型文献
基于网络药理学的小陷胸汤治疗大肠癌的机制研究
文献摘要:
目的 采用网络药理学探究小陷胸汤治疗大肠癌的作用机制.方法 通过中药系统药理学数据库及分析平台(TCMSP),对组成小陷胸汤的3个单味药半夏、瓜蒌和黄连分别进行活性成分的收集和筛选,构建成分-靶点网络图,同时采用GeneCards数据库获取大肠癌疾病靶点.应用Cytoscape软件,采用蛋白互作的方式,垂钓小陷胸汤治疗大肠癌的核心靶点,并采用ClueGo对核心靶点进行基因本体(gene ontology,GO)和通路的富集分析.采用PyRx软件对核心成分及蛋白靶点进行分子对接,对网络药理学的研究结果进行验证.结果 筛选得到32个小陷胸汤治疗大肠癌的活性成分,181个对应的蛋白靶点及9329个大肠癌疾病靶点.通过靶点垂钓的方式,得到360个小陷胸汤治疗大肠癌的核心靶点.GO富集分析发现,小陷胸汤治疗大肠癌在生物过程(biological process,BP)方面,与烟酰胺腺嘌呤二核苷酸(nicotinamide adenine dinucleotide,NAD)依赖性组蛋白脱乙酰酶活性、消旋酶活性负调控、胆囊收缩素反应、调节脱氧核糖核酸酶活性等有关;分子功能(molecular function,MF)方面,与蛋白质丝氨酸/苏氨酸激酶活性、蛋白质丝氨酸/苏氨酸激酶活性调节、腺嘌呤核苷三磷酸(adenosine-triphosphate,ATP)结合、凋亡过程中半胱氨酸型内肽酶活性调节等有关;在细胞组成(cellular component,CC)方面,主要与纺锤体微管、组蛋白脱乙酰酶复合物、核小体、ESC/E (Z)复合物有关.信号通路富集分析注释得到胃泌素信号、细胞周期、乙型肝炎感染、DNA损伤反应4个相关通路.分子对接结果表明由小陷胸汤中筛选出的活性成分与对应的蛋白靶点具有良好的结合能力.结论 小陷胸汤通过调控胃泌素信号通路、细胞周期通路、乙型肝炎感染通路、DNA损伤反应通路治疗大肠癌.
文献关键词:
小陷胸汤;网络药理学;大肠癌;胃泌素信号通路;细胞周期通路;乙型肝炎感染通路;DNA损伤反应通路
作者姓名:
高世勇;李婉秋;王帅;石佳;谭慧心
作者机构:
哈尔滨商业大学药物工程技术研究中心,黑龙江哈尔滨150076;黑龙江省肿瘤预防与抗肿瘤药物研究重点实验室,黑龙江哈尔滨 150076;哈尔滨医科大学附属第四医院药学部,黑龙江哈尔滨150001
文献出处:
引用格式:
[1]高世勇;李婉秋;王帅;石佳;谭慧心-.基于网络药理学的小陷胸汤治疗大肠癌的机制研究)[J].中草药,2022(03):773-782
A类:
PyRx,胃泌素信号通路,乙型肝炎感染通路
B类:
网络药理学,小陷胸汤,大肠癌,系统药理学,分析平台,TCMSP,单味药,半夏,瓜蒌,黄连,活性成分,靶点网络,网络图,GeneCards,Cytoscape,蛋白互作,垂钓,核心靶点,ClueGo,基因本体,gene,ontology,核心成分,蛋白靶点,分子对接,选得,生物过程,biological,process,烟酰胺腺嘌呤二核苷酸,nicotinamide,adenine,dinucleotide,NAD,组蛋白脱乙酰酶,消旋,负调控,胆囊收缩素,脱氧核糖核酸,核糖核酸酶活性,molecular,function,MF,丝氨酸,苏氨酸,激酶活性,腺嘌呤核苷三磷酸,adenosine,triphosphate,ATP,内肽酶,细胞组成,cellular,component,CC,纺锤体,微管,复合物,核小体,ESC,信号通路富集,通路富集分析,相关通路,结合能,细胞周期通路
AB值:
0.304847
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