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典型文献
基于mtDNAD-loop区和Cyt b基因序列对鹅喉羚南疆亚种遗传多样性与系统进化地位的分析
文献摘要:
为进一步明确南疆地区鹅喉羚(Gazella subgutturosa)的遗传分化、遗传多样性水平和系统进化地位,以鹅喉羚南疆亚种(G.s.yarkandensis)为研究对象,运用PCR扩增和测序技术,研究mtDNA D-loop区和mtDNA Cyt b基因的序列特征,利用邻接法构建系统发育树和中介网络关系,以此阐明鹅喉羚南疆亚种的遗传多样性水平和系统进化地位.结果表明:鹅喉羚南疆亚种mtDNA D-loop区序列碱基A、T含量为60.38%,存在23个多态位点,占总位点数的2.90%,其中包括单一多态位点8个,简约性信息位点15个,存在6处插入和缺失,14个个体存在7个单倍型;平均单倍型多样度为0.813,核苷酸多样度为0.00890,平均核苷酸差异度为7.747.mtDNA Cyt b基因序列碱基A、T含量为58.39%,存在5个多态位点,占总位点数的0.46%,其中包括单一多态位点1个,简约性信息位点4个,14个个体存在4个单倍型;平均单倍型多样度为0.714,核苷酸多样度为0.00159,平均核苷酸差异度为1.725.以上数据表明鹅喉羚南疆亚种单倍型多样度远高于核苷酸多样度,具有非常丰富的遗传多样性.系统发育分析表明,鹅喉羚南疆亚种与其他亚种出现了明显的遗传分化,聚类于明显不同的进化支.网络关系分析表明,鹅喉羚具有明显的地理分布特征,研究涉及的鹅喉羚南疆亚种的单倍型大多聚于同一进化支,建议在南疆地区设立自然保护区,加强对鹅喉羚栖息地的生态保护,从而提高其生存适应性.
文献关键词:
鹅喉羚南疆亚种;mtDNAD-loop区;Cyt b基因;遗传多样性;系统进化地位
作者姓名:
张永浩;韦庆浩;郭丽君;阿布都热合曼·吐尔逊;王玉涛
作者机构:
喀什大学生命与地理科学学院, 新疆帕米尔高原生物资源与生态重点实验室, 喀什, 844000
文献出处:
引用格式:
[1]张永浩;韦庆浩;郭丽君;阿布都热合曼·吐尔逊;王玉涛-.基于mtDNAD-loop区和Cyt b基因序列对鹅喉羚南疆亚种遗传多样性与系统进化地位的分析)[J].野生动物学报,2022(02):354-363
A类:
鹅喉羚南疆亚种,subgutturosa
B类:
mtDNAD,loop,Cyt,基因序列,遗传多样性,系统进化地位,南疆地区,Gazella,遗传分化,yarkandensis,序列特征,邻接,接法,建系,系统发育树,中介网络,网络关系,碱基,多态位点,一多,简约性,个个,单倍型,差异度,上数,非常丰富,系统发育分析,关系分析,地理分布,多聚,自然保护区,栖息地,生存适应
AB值:
0.194203
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