典型文献
维甲酸诱导小鼠神经管畸形胚脑中H2BK120ub1的全基因组状态变化
文献摘要：
目的 利用染色质免疫共沉淀测序技术(ChIP-seq)分析E10.5 d正常小鼠胚脑组织与维甲酸(RA)诱导神经管缺陷(NTDs)小鼠胚脑组织H2BK120单泛素化(H2BK120ub1)修饰的全基因图谱,以期发现H2BK120ub1修饰与神经管发育通路基因表达的关系,为NTDs的诊断及治疗提供生物学靶点及依据.方法 孕鼠分为随机对照组和RA诱导的NTDs组,利用ChIP-seq技术对获得的H2BK120ub1特异结合DNA片段进行序列鉴定,获取比对Reads,进行全基因组的Peak分析、基因注释(GO)以及功能富集分析peak相关基因的生物学功能.结果 E10.5 d正常小鼠脑组织和RA诱导神经管畸形小鼠脑组织两组间有306个基因有显著的H2BK120ub1差异,根据GO富集的基因个数进行统计:在cellular component 中前三位为别为 Cell(82 个基因),Cell part(82 个基因),Organelle part(52 个基因);在 biological process 中前三位为别为 celluar process(68 个基因),metabolic process(47 个基因),biological regulation(40 个基因);KEGG通路分析的结果主要富集于刺猬因子(HH)信号通路、TGF-beta信号通路、Wnt信号通路等参与调控神经管发育的关键信号通路,有显著统计学意义(P＜0.05).结论 H2BK120ub1修饰的差异可作为NTDs的一个潜在的诊断及治疗靶点.
文献关键词：
维甲酸;H2BK120ub;神经管缺陷;染色质免疫共沉淀测序技术
中图分类号：
作者姓名：
王珊;何学佳;成翕悦;林烨;裴培;占小俊
作者机构：
首都儿科研究所,北京市儿童发育与营养学重点实验室,北京 100020;北京大学首都儿科研究所教学医院;河北医科大学第三医院
文献出处：
引用格式：
[1]王珊;何学佳;成翕悦;林烨;裴培;占小俊-.维甲酸诱导小鼠神经管畸形胚脑中H2BK120ub1的全基因组状态变化)[J].中国儿童保健杂志,2022(07):731-736
A类：
H2BK120ub1,染色质免疫共沉淀测序技术,H2BK120,celluar,H2BK120ub
B类：
维甲酸,神经管畸形,全基因组,状态变化,ChIP,seq,E10,RA,神经管缺陷,NTDs,泛素化,基因图谱,神经管发育,路基,诊断及治疗,孕鼠,序列鉴定,Reads,Peak,基因注释,功能富集分析,peak,生物学功能,小鼠脑组织,cellular,component,前三位,Cell,part,Organelle,biological,process,metabolic,regulation,通路分析,刺猬,HH,TGF,beta,Wnt,治疗靶点
AB值：
0.276577
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