典型文献
猪50K液相芯片基因组选择效果分析
文献摘要：
本研究收集了1267头大白猪的生长性能测定记录和800头大白猪的繁殖记录,并用猪50K固相芯片(Geneseek)及基于靶向捕获测序技术的猪50K液相芯片(液相50K)进行基因型分型,比较2款芯片基因组选择的准确性.采用一步法模型,估计达百公斤体重日龄、百公斤活体背膘厚和总产仔数3个性状的基因组育种值.本研究探究不同参考群体规模对基因组选择的影响,生长性状设置500和10002个参考群体规模,繁殖性状设置400和7002个参考群体规模.结果表明,液相50K与Geneseek芯片具有很好的兼容性,液相50K在2个生长性状的基因组选择准确性比Geneseek平均高出1.7％,对总产仔数的基因组选择准确性略高于Geneseek,但提升幅度较小.2款芯片的并集使标记数增加到62039个SNP,基因组选择准确性比单款芯片平均提升2.9％.无论是单款芯片还是2款芯片并集,随着参考群体规模扩大,基因组选择准确性明显上升.本研究表明液相芯片技术能够用于基因组选择且有优势,研究结果可为我国猪分子育种提供参考.
文献关键词：
猪;液相芯片;基因组选择
中图分类号：
作者姓名：
邱奥;张梓鹏;王雪;罗文学;王贵江;丁向东
作者机构：
中国农业大学动物科学技术学院,畜禽育种国家工程实验室,农业农村部动物遗传育种与繁殖重点实验室,北京 100193;河北省畜牧良种工作总站,河北石家庄 050049
文献出处：
引用格式：
[1]邱奥;张梓鹏;王雪;罗文学;王贵江;丁向东-.猪50K液相芯片基因组选择效果分析)[J].中国畜牧杂志,2022(08):82-86
A类：
Geneseek
B类：
50K,液相芯片,片基,基因组选择,大白猪,生长性能,性能测定,靶向捕获,基因型,一步法,百公斤,日龄,活体背膘厚,总产仔数,基因组育种,育种值,参考群体,群体规模,生长性状,繁殖性状,兼容性,略高于,升幅,记数,SNP,芯片技术,够用,分子育种
AB值：
0.250114
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