典型文献
管纹艳虎天牛糖苷水解酶基因家族的鉴定和表达谱分析
文献摘要：
昆虫糖苷水解酶(Glycoside hydrolase,GH)在寄主植物糖类化合物的水解过程中扮演着重要作用,但是在管纹艳虎天牛Rhiaphuma horsfieldi中尚未有GH基因的报道.基于测序的转录组数据,本研究从管纹艳虎天牛中鉴定到 7 个 RhorGHs 家族:GH1、GH9、GH13、GH16、GH28、GH31 和 GH45,分别具有 23、1、4、2、10、12和4个基因,其中23个基因具有全长序列.在进化分析中,管纹艳虎天牛不同GH家族的成员主要以物种特异的形式聚类,尤其是GH1和GH28家族.三级结构分析显示,RhorGH28家族的蛋白主要由β折叠组成,不同蛋白间具有高度保守的结构和与糖类化合物互作的关键氨基酸位点,包括质子供体、催化亲核残基和底物结合位点.在表达谱分析中,大部分RhorGHs基因主要在雌雄虫腹部特异或高表达,暗示其可能在与消化有关的肠道中表达.研究结果明确了管纹艳虎天牛GH家族及其数量,以及各家族的序列特征和进化关系,可为该天牛的寄主植物适应性机制研究提供借鉴.
文献关键词：
管纹艳虎天牛;糖苷水解酶;进化分析;同源建模;表达谱
中图分类号：
作者姓名：
糯淑梅;王政全;吴春;杨安锦;刘乃勇
作者机构：
西南林业大学,云南省森林灾害预警与控制重点实验室,昆明650224
文献出处：
引用格式：
[1]糯淑梅;王政全;吴春;杨安锦;刘乃勇-.管纹艳虎天牛糖苷水解酶基因家族的鉴定和表达谱分析)[J].环境昆虫学报,2022(04):921-934
A类：
管纹艳虎天牛,Glycoside,Rhiaphuma,horsfieldi,RhorGHs,GH9,GH13,GH28,GH31,GH45,RhorGH28
B类：
糖苷水解酶,酶基因,基因家族,表达谱分析,昆虫,hydrolase,寄主植物,糖类化合物,转录组数据,GH16,别具,全长,进化分析,三级结构,折叠,关键氨基酸位点,质子,供体,残基,底物,结合位点,雌雄,异或,暗示,各家,序列特征,进化关系,适应性机制,同源建模
AB值：
0.224518
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