典型文献
基于串联质谱标签技术的甲状腺相关眼病眼外肌蛋白组学研究
文献摘要:
目的:使用串联质谱标签(TMT)方法筛选甲状腺相关眼病(TAO)继发限制性斜视患者和共同性斜视患者的眼外肌差异表达蛋白。方法:收集2019年8月至2020年12月于北京大学人民医院眼科诊断为TAO继发限制性斜视并行斜视矫正术5例患者的眼外肌标本,收集同期5例共同性内斜视行斜视矫正术患者的眼外肌作为对照。采用基于TMT的蛋白质组学技术,对TAO组和对照组眼外肌的差异表达蛋白进行筛选及生物信息学分析。设定倍数变化≥1.2或≤0.83且
P值<0.05作为筛选差异表达蛋白的阈值。利用UniProtGOA蛋白数据库和STRING蛋白网络互作数据库分析差异表达蛋白的基因本体(GO)注释、KEGG通路富集和蛋白-蛋白相互作用关系。
结果:TAO组与对照组眼外肌总差异表达蛋白数量为53个,其中表达上调蛋白34个,表达下调蛋白19个。通过GO注释发现,按其生物学过程分类,这些差异表达蛋白主要参与了对刺激的反应过程、多细胞生物过程、代谢过程、发育过程、细胞内信号转导、正向生物调控过程;KEGG通路富集分析发现差异表达蛋白主要参与了局部黏附、紧密连接、细胞骨架调控、凋亡等通路。蛋白-蛋白相互作用分析发现肌球蛋白重链2、肌球蛋白重链7、肌球蛋白调节轻链、α辅肌动蛋白2、纤维蛋白原α链和纤维蛋白原β链6个关键蛋白。结论:TAO继发限制性斜视患者与共同性斜视患者的眼外肌中蛋白表达存在差异,肌球蛋白、辅肌动蛋白、细丝蛋白可能通过参与细胞骨架调控、局部黏附等参与TAO的发病机制。
文献关键词:
甲状腺相关眼病;限制性斜视;蛋白组学;质谱分析法
中图分类号:
作者姓名:
孟庆娱;梁舒婷;王毅;王乐今;赵明威;吴夕
作者机构:
北京大学人民医院眼科 眼视光中心 眼病与视光医学研究所 视网膜脉络膜疾病诊治研究北京市重点实验室 北京大学医学部眼视光学院,北京 100044
文献出处:
引用格式:
[1]孟庆娱;梁舒婷;王毅;王乐今;赵明威;吴夕-.基于串联质谱标签技术的甲状腺相关眼病眼外肌蛋白组学研究)[J].中华实验眼科杂志,2022(11):1006-1012
A类:
限制性斜视,UniProtGOA
B类:
串联质谱标签技术,甲状腺相关眼病,眼外肌,肌蛋白,蛋白组学,组学研究,TMT,TAO,共同性斜视,差异表达蛋白,北京大学人民医院,眼科,斜视矫正术,内斜视,蛋白质组学技术,生物信息学分析,倍数,STRING,蛋白网络,作数,数据库分析,基因本体,蛋白相互作用,相互作用关系,生物学过程,反应过程,多细胞,生物过程,代谢过程,细胞内信号,信号转导,生物调控,通路富集分析,紧密连接,细胞骨架,相互作用分析,肌球蛋白重链,轻链,肌动蛋白,纤维蛋白原,关键蛋白,细丝,丝蛋白,质谱分析法
AB值:
0.239048
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