典型文献
基于Ti4+-IMAC富集的分枝菌酸小杆菌深度覆盖磷酸化蛋白质组研究
文献摘要:
[目的 ]本研究以分枝菌酸小杆菌(Mycolicibacterium smegmatis)为研究对象,探索适于原核微生物理想的磷酸化富集方法.[方法]我们比较了二氧化钛(TiO2)、Fe3+-NTA和Ti4+螯合在磷酸酯修饰的固相微球(Ti4+-IMAC)3种不同富集方法磷酸化肽段的富集效率,并用不同分辨率的质谱仪评估富集稳定性.[结果]Ti4+-IMAC富集效率最高,磷酸化位点数是TiO2或Fe3+-NTA方法的7倍以上;TiO2和Fe3+-NTA方法富集到的磷酸化位点数相差不大,与已报道的用TiO2方法富集的磷酸化位点数目接近.Ti4+-IMAC富集结果稳定性很好,高分辨率Lumos质谱仪鉴定到的磷酸化位点数是Velos的2.6倍.[结论]本研究较高效地实现了分枝菌酸小杆菌磷酸化事件的鉴定,共鉴定到2 280个磷酸化蛋白、10 880个磷酸化肽段及4 433个可信磷酸化位点,有望用于其他微生物的磷酸化蛋白质组学研究.
文献关键词:
分枝菌酸小杆菌;磷酸化蛋白质组;TiO2;Fe3+-NTA;Ti4+-IMAC
中图分类号:
作者姓名:
蒙书红;常蕾;柳峰松;徐平;张瑶
作者机构:
河北大学生命科学学院,河北保定071002;军事科学院军事医学研究院生命组学研究所,中国医学科学院蛋白质组学与药物研发新技术创新单元,国家蛋白质科学中心(北京),北京蛋白质组研究中心,蛋白质组学国家重点实验室,北京102206
文献出处:
引用格式:
[1]蒙书红;常蕾;柳峰松;徐平;张瑶-.基于Ti4+-IMAC富集的分枝菌酸小杆菌深度覆盖磷酸化蛋白质组研究)[J].微生物学报,2022(10):3768-3783
A类:
IMAC,分枝菌酸小杆菌,Lumos
B类:
Ti4+,深度覆盖,Mycolicibacterium,smegmatis,适于,原核,富集方法,二氧化钛,TiO2,Fe3+,NTA,螯合,磷酸酯,微球,磷酸化肽段,富集效率,质谱仪,集结,Velos,磷酸化蛋白质组学,组学研究
AB值:
0.18052
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