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福鼎大白茶蛋白质相互作用网络研究
文献摘要：
蛋白质相互作用网络的构建可以为探究茶树生长过程中的关键蛋白并预测其功能提供理论参考.以贵州都匀地区福鼎大白茶为研究对象,利用三代Nanopore测序技术和同源比对方法构建福鼎大白茶根、茎、叶差异基因蛋白质相互作用网络,通过网络进一步预测关键蛋白及其功能.结果表明,叶与根、叶与茎、茎与根和根茎叶差异基因蛋白质相互作用网络中的关键蛋白分别为53、39、42和53个,并且预测出了关键蛋白的功能,如TEA003744的功能可能为腺苷酸激酶活性、蛋白质丝氨酸/苏氨酸激酶活性和ATP结合,参与光合作用和蛋白质磷酸化过程;TEA026776可能为发育蛋白,参与细胞分化过程和蛋白质磷酸化过程,还具有ATP结合活性和蛋白激酶活性;TEA019056的功能可能为ATP结合、GTP结合和GTP酶活性,参与过氧化物酶体组织的组成和蛋白质磷酸化等.随后预测出4个网络中打分最高功能模块的功能,并进行拓扑属性分析、功能模块分析、集群注释和聚类分析.研究结果可为鉴定蛋白质的功能、寻找关键蛋白及选育优良品种等提供理论依据.
文献关键词：
福鼎大白茶;蛋白质相互作用网络;关键蛋白;蛋白质功能
中图分类号：
作者姓名：
王芬;潘发莲;杨秀;韦永欢;裴会敏
作者机构：
黔南民族师范学院生物科学与农学院,贵州 都匀 558000
文献出处：
引用格式：
[1]王芬;潘发莲;杨秀;韦永欢;裴会敏-.福鼎大白茶蛋白质相互作用网络研究)[J].生物技术进展,2022(04):623-629
A类：
TEA003744,TEA026776,TEA019056
B类：
福鼎大白茶,蛋白质相互作用网络,茶树生长,生长过程,关键蛋白,都匀,Nanopore,同源比对,比对方法,差异基因,白及,根茎叶,预测出,腺苷酸,激酶活性,丝氨酸,苏氨酸,ATP,光合作用,蛋白质磷酸化,酸化过程,细胞分化,结合活性,蛋白激酶,GTP,过氧化物酶体,打分,功能模块,拓扑属性,属性分析,选育,优良品种,蛋白质功能
AB值：
0.237316
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