典型文献
复杂性肛瘘患者肠道微生态检测及分析
文献摘要:
目的:通过16S rDNA基因测序检测复杂性肛瘘患者的肠道菌群分布,探讨其与健康人的菌群分布是否存在差异。方法:采用病例对照研究方法,回顾性收集2020年6月至12月期间杭州市第三人民医院接受手术治疗的30例复杂性肛瘘患者临床资料(复杂性肛瘘组),并按1∶1配比选择本院健康体检人群30例作为对照组(健康对照组)。病例纳入标准:(1)符合腺源性肛瘘诊断的标准,且症状持续3个月以上;(2)术前已行电子结肠镜检查排除肠道炎性反应、炎性肠病等;(3)复杂性肛瘘的定义为符合下面情况之一者:瘘管跨越2/3及以上的肛门括约肌;包含两个以上的外口或瘘管;既往已行肛瘘手术后确认复发者。排除标准:(1)合并有炎性肠病、慢性腹泻或便秘、糖尿病、消化道恶性肿瘤、肝肾功能障碍等;(2)克罗恩病、外伤、特殊感染(如放线菌病和结核病)等引起的肛瘘;(3)近1个月内使用过抗生素、益生元、益生菌等可能影响肠道微生态制剂者;(4)认知缺陷不能配合者。提取研究对象的粪便样本总DNA,扩增细菌16S rDNA基因序列的V4高变区,利用Illumina Miseq平台进行高通量测序,最后进行操作分类单元(OTU)聚类、进行Alpha多样性和LEfSE数据分析,其中Chao指数或ACE指数越大,表明微生物区系的预期物种丰度越高,Simpson指数越小或Shannon指数越大,表明微生物区系多样性越高。两组间性别、年龄、体质指数(BMI)、饮酒吸烟史基线资料比较差异均无统计学意义(均
P>0.05),说明两组具有可比性。本研究观察指标包括两组的测序和质量控制、Alpha多样性分析和物种及其丰度分析以及LEfSE分析。
结果:复杂性肛瘘组与健康对照组的主要优势菌都是厚壁菌门和拟杆菌门,分别占93.4%±32.0%和87.4%±41.2%;在属水平上,复杂性肛瘘组的普雷沃菌属(4.9%±7.4%比0.1%±1.1%,
P<0.001)、巨细胞菌属(3.9%±8.2%比0.5%±4.2%,
P<0.05)和毛螺菌属(2.6%±5.7%比0.1%±3.4%,
P<0.05)的丰度明显更高,而变形菌属(0.02%±4.2%比9.3%±14.4%,
P<0.01)、肠球菌属(0.02%±2.3%比9.3%±19.6%,
P<0.05)、拟杆菌属(24.7%±9.9%比29.8%±9.1%,
P<0.05)和克雷伯菌属(0.4%±4.2%比3.9%±7.3%,
P<0.05)相对更低。与健康对照组相比,复杂性肛瘘组肠道菌群多样性更丰富,表现为ACE指数更高[(293.30±44.00)比(218.75±33.83),
t=102.069,
P<0.001],Chao指数也更高[(318.40±41.99)比(250.00±46.38),
t=77.818,
P=0.028],Shannon指数更高[(3.36±0.29)比(2.43±0.34),
t=9.657,
P=0.001];而Simpson指数更低[(0.103±0.013)比(0.131±0.013),
t=5.551,
P=0.046],差异均有统计学意义(均
P<0.05)。韦荣菌科、Selenemondales 及厌氧菌纲(均属于厚壁菌门)的菌株总体上对两组样本肠道菌群差异的影响最大(LDA 值均>4)。
结论:与健康对照组相比,复杂性肛瘘患者肠道菌群多样性更丰富,提示某些肠道菌群及其代谢产物可能在肛瘘发病中发挥了一定的作用。
文献关键词:
肛瘘,复杂性;肠道微生态;高通量测序
中图分类号:
作者姓名:
裘建明;杨关根;王东;陈金明;沈忠;邵书先
作者机构:
杭州市第三人民医院肛肠外科 浙江省中西医结合盆底疾病实验室,杭州 310009
文献出处:
引用格式:
[1]裘建明;杨关根;王东;陈金明;沈忠;邵书先-.复杂性肛瘘患者肠道微生态检测及分析)[J].中华胃肠外科杂志,2022(09):792-797
A类:
LEfSE,Selenemondales
B类:
复杂性肛瘘,肛瘘患者,检测及分析,16S,rDNA,基因测序,肠道菌群分布,健康人,病例对照研究,杭州市,第三人,比选,本院,健康体检人群,纳入标准,电子结肠镜,结肠镜检查,肠道炎性反应,炎性肠病,一者,瘘管,肛门括约肌,肛瘘手术,手术后,排除标准,慢性腹泻,便秘,消化道恶性肿瘤,肝肾功能,克罗恩病,外伤,特殊感染,放线菌病,结核病,益生元,益生菌,肠道微生态制剂,认知缺陷,粪便样本,基因序列,V4,Illumina,Miseq,操作分类单元,OTU,Alpha,Chao,ACE,微生物区系,物种丰度,Simpson,Shannon,体质指数,饮酒,吸烟史,可比性,多样性分析,主要优势,优势菌,厚壁菌门,拟杆菌门,普雷沃菌属,巨细胞,肠球菌属,拟杆菌属,克雷伯菌,肠道菌群多样性,韦荣菌,厌氧菌,菌群差异,LDA,代谢产物
AB值:
0.312347
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