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典型文献
基于TMT和PRM技术筛选番茄响应盐胁迫差异表达蛋白
文献摘要:
[目的]盐胁迫是造成番茄产量损失和品质严重下降的关键非生物胁迫之一,研究番茄耐盐的分子机制,为认识番茄幼苗应答盐胁迫分子调控机制奠定基础.[方法]研究利用番茄耐盐渐渗系IL-7-5-5和番茄盐敏感M82为试材,采用同位素相对标记与绝对定量(TMT)技术结合定量蛋白质组平行反应监测(PRM)技术,对200 mM盐胁迫12 h的番茄幼苗叶片进行蛋白质组学研究,筛选出盐胁迫响应显著的潜在靶标蛋白.[结果](1)共鉴定出286个差异显著表达蛋白(DEPs).盐胁迫下IL-7-5-5鉴定到191个DEPs,其中119个表达上调,72个表达下调.在M82中鉴定出157个DEPs,其中84个表达上调,73个表达下调.维恩图分析显示,有129和95个差异蛋白分别特异于IL-7-5-5和M82.有62个显著差异蛋白共表达,其中28个在IL-7-5-5和M82中均上调,15个均为下调,表现出对盐胁迫的一致响应.19个显著差异蛋白在表达相反,有5个蛋白质在ST中下调,在SS中上调,14个差异蛋白在ST中上调,在SS中下调;(2)番茄盐反应蛋白种类诱导能力强,主要与代谢过程、单组织过程以及细胞过程有关,细胞组成主要涉及细胞、细胞器、分子复合物和膜,基因本体分子功能显示,这些差异性蛋白主要参与催化活性、绑定和分子功能调控.(3)选择11个显著差异蛋白PRM验证结果与TMT定量表现出相同的趋势.差异蛋白包括A0A3Q7E8T9、A0A3Q7EK65、A0A3Q7FY19、A0A3Q7G430、A0A3Q7ITH0、A0A3Q7J1Y7、P05116、Q43779、A0A3Q7F8W6、A0A3Q7GKU3、A0A3Q7J0Z4,可能是番茄幼苗耐盐的潜在靶标蛋白.[结论]研究采用TMT结合PRM技术,筛选出番茄幼苗响应盐胁迫差异表达蛋白.
文献关键词:
番茄;盐胁迫;蛋白质组学;TMT;PRM
作者姓名:
王强;刘会芳;韩宏伟;庄红梅;王柏柯;王娟;杨涛;王浩;秦勇
作者机构:
新疆农业科学院园艺作物研究所/新疆蔬菜工程技术研究中心,乌鲁木齐 830091;新疆农业大学园艺学院,乌鲁木齐 830052
文献出处:
引用格式:
[1]王强;刘会芳;韩宏伟;庄红梅;王柏柯;王娟;杨涛;王浩;秦勇-.基于TMT和PRM技术筛选番茄响应盐胁迫差异表达蛋白)[J].新疆农业科学,2022(06):1418-1428
A类:
A0A3Q7E8T9,A0A3Q7EK65,A0A3Q7FY19,A0A3Q7G430,A0A3Q7ITH0,A0A3Q7J1Y7,P05116,Q43779,A0A3Q7F8W6,A0A3Q7GKU3,A0A3Q7J0Z4
B类:
TMT,PRM,技术筛选,盐胁迫,差异表达蛋白,番茄产量,产量损失,非生物胁迫,耐盐,番茄幼苗,分子调控机制,研究利用,盐敏感,M82,同位素,绝对定量,技术结合,合定,平行反应监测,mM,蛋白质组学,组学研究,胁迫响应,靶标蛋白,DEPs,维恩图,差异蛋白,异于,共表达,ST,SS,白种,诱导能力,代谢过程,组织过程,细胞组成,细胞器,复合物,基因本体,催化活性,绑定,功能调控,白包
AB值:
0.259522
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