典型文献
转录组和iTRAQ技术联合揭示玉米根系的耐旱机制
文献摘要：
采用RNA-Seq技术和iTRAQ技术对耐旱性不同的两玉米自交系(昌7-2和TS141)的幼苗根系差异基因(DEGs)和差异蛋白(DEPs)进行关联分析.定量关联分析结果表明,Chang 7-2 D1 vs CK1、Chang 7-2 D2 vs CK2、TS141 D1 vs CK1和TS141 D2 vs CK2等4个比较组中mRNA和蛋白表达趋势相同的基因相关系数分别为0.7993、0.5673、0.6406、0.6588,mRNA和蛋白表达趋势相反的基因相关系数分别为-0.7222、-0.5752、-0.7996、-0.7339;此外,通过对每个自交系的D1 vs CK1和D2 vs CK2关联结果进行整合后发现,在干旱胁迫下,昌7-2中mRNA和蛋白表达趋势相同的基因有19个,mRNA和蛋白表达趋势相反的基因有9个,TS141中mRNA和蛋白表达趋势相同的基因有11个,mRNA和蛋白表达趋势相反的基因有0个,表明植物根系在转录和转录后调控过程中存在差异.KEGG分析发现4个比较组所关联到的DEGs/DEPs主要涉及苯丙素的生物合成、次生代谢产物的生物合成和核糖体等,这些通路可能是不同自交系幼苗根系共同响应干旱胁迫的主要通路.在昌7-2和TS141中挑选9个DEPs/DEGs表达趋势相同的基因进行qRT-PCR分析表明,9个DEPs/DEGs的表达趋势与它们的RNA-Seq和iTRAQ结果基本一致.
文献关键词：
玉米;根系;转录组;蛋白质组;关联分析;耐旱机制
中图分类号：
作者姓名：
白明兴;庄泽龙;姬祥卓;彭云玲
作者机构：
甘肃农业大学农学院,甘肃省干旱生境作物学重点实验室/甘肃省作物遗传改良与种质创新重点实验室,甘肃 兰州730070
文献出处：
引用格式：
[1]白明兴;庄泽龙;姬祥卓;彭云玲-.转录组和iTRAQ技术联合揭示玉米根系的耐旱机制)[J].干旱地区农业研究,2022(02):59-68
A类：
TS141
B类：
转录组,iTRAQ,玉米根系,耐旱机制,Seq,耐旱性,玉米自交系,幼苗根系,差异基因,DEGs,差异蛋白,DEPs,定量关联,Chang,D1,CK1,D2,CK2,干旱胁迫,植物根系,转录后调控,苯丙素,生物合成,次生代谢产物,核糖体,qRT,蛋白质组
AB值：
0.242868
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