典型文献
基于公共数据库综合分析转录因子19在胰腺癌中的表达与预后作用
文献摘要：
目的 探究转录因子19(transcription factor 19,TCF19)在胰腺癌中的表达及临床意义,并构建相关预后模型.方法 利用Oncomine与GEPIA数据库提取数据并分析TCF19在正常胰腺组织与胰腺腺癌中的表达差异;利用GEPIA与Kaplan-Meier plotter数据库分析TCF19的表达水平与胰腺腺癌病人预后之间的相关性;利用MethSurv数据库分析TCF19基因甲基化位点在胰腺腺癌中的分布情况;利用TISIDB与TIMER数据库分析在胰腺腺癌中TCF19是否与肿瘤浸润淋巴细胞(tumor infiltrating lymphocytes,TIL)、免疫调节剂、趋化因子、免疫浸润细胞等相关;利用R统计软件进行单因素Cox、LASSO回归分析与多因素Cox回归分析构建预后预测模型,并在验证组中进行验证.结果 Oncomine与GEPIA显示,胰腺腺癌中TCF19的表达水平明显高于正常组织(P<0.05);运用Kaplan-Meier生存分析发现,胰腺腺癌中高表达TCF19病人较低表达TCF19病人预后差;MethSurv数据库鉴定得到11个TCF19甲基化位点与预后相关;TISIDB和TIMER数据库挖掘发现TCF19与TIL、免疫调节剂、趋化因子和免疫浸润细胞相关;利用R软件鉴定得到4个与TCF19相关基因(ANLN、FAM111B、DLGAP5、CEP55)并构建预后模型,该模型在训练组与验证组中均具有良好的预测能力.结论 T C F19基因在胰腺癌中高表达,与病人不良预后有关.T C F19相关基因预后模型能很好地评估、预测胰腺癌病人的预后.
文献关键词：
转录因子19;胰腺癌;预后模型;癌症基因图谱数据库
中图分类号：
作者姓名：
余志龙;童山石;姜可伟
作者机构：
北京大学人民医院胃肠外科北京大学人民医院外科肿瘤研究室结直肠癌诊疗研究北京市重点实验室,北京1000442;上海交通大学医学院附属仁济医院胆胰外科,上海200127
文献出处：
引用格式：
[1]余志龙;童山石;姜可伟-.基于公共数据库综合分析转录因子19在胰腺癌中的表达与预后作用)[J].腹部外科,2022(05):317-324
A类：
TCF19,FAM111B
B类：
公共数据库,胰腺癌,预后作用,transcription,预后模型,Oncomine,GEPIA,提取数据,胰腺组织,表达差异,Kaplan,Meier,plotter,数据库分析,癌病,MethSurv,基因甲基化,甲基化位点,TISIDB,TIMER,肿瘤浸润淋巴细胞,tumor,infiltrating,lymphocytes,TIL,免疫调节剂,趋化因子,免疫浸润细胞,统计软件,Cox,LASSO,预后预测模型,正常组织,生存分析,低表达,软件鉴定,ANLN,DLGAP5,CEP55,训练组,预测能力,不良预后,癌症基因图谱数据库
AB值：
0.285239
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