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典型文献
网络药理学联合GEO测序数据和分子对接探索大黄素治疗急性胰腺炎的作用机制
文献摘要:
目的 利用网络药理学联合GEO测序数据、分子对接技术探索大黄素治疗急性胰腺炎的潜在作用机制.方法 借助PubChem、SwissTargetPrediction、DrugBank、PharmMapper、TTD、CTD数据库获取大黄素作用靶点,通过GeneCards、OMIM、DrugBank、CTD数据库以及GSE194331数据集差异分析结果获取急性胰腺炎疾病靶点,二者取交集得到大黄素治疗急性胰腺炎靶点.使用String数据库和Cytoscape软件构建靶点蛋白互作网络,R软件ClusterProfiler包对靶点功能富集分析,Cytoscape的CytoNCA插件筛选核心靶点.使用PyMOL和Autodock软件进行分子对接和结果可视化.结果 大黄素治疗急性胰腺炎的潜在作用靶点有246个,主要涉及脂质与动脉粥样硬化、P13K-AKT信号通路、FoxO信号通路、HIF-1信号通路以及IL-17信号通路等.其中20个核心靶点与大黄素均有结合潜力,CTNNB1、HIF1A和IL1B等9个靶点与大黄素有良好的结合潜力.结论 大黄素通过多靶点、多通路发挥治疗急性胰腺炎的作用.
文献关键词:
大黄素;急性胰腺炎;网络药理学;GEO数据库;分子对接;靶点
作者姓名:
邓弘扬;魏丰贤;马尚贤;韩伟;王满才;徐小东;张有成
作者机构:
兰州大学第二医院 普通外科,甘肃 兰州 730030
文献出处:
引用格式:
[1]邓弘扬;魏丰贤;马尚贤;韩伟;王满才;徐小东;张有成-.网络药理学联合GEO测序数据和分子对接探索大黄素治疗急性胰腺炎的作用机制)[J].现代药物与临床,2022(06):1189-1195
A类:
GSE194331
B类:
网络药理学,学联,GEO,序数,大黄素,急性胰腺炎,利用网络,分子对接技术,技术探索,潜在作用,PubChem,SwissTargetPrediction,DrugBank,PharmMapper,TTD,CTD,作用靶点,GeneCards,OMIM,交集,String,Cytoscape,软件构建,靶点蛋白,蛋白互作网络,ClusterProfiler,对靶,功能富集分析,CytoNCA,插件,核心靶点,PyMOL,Autodock,动脉粥样硬化,P13K,AKT,FoxO,CTNNB1,HIF1A,IL1B,多靶点,多通路
AB值:
0.311902
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