典型文献
基于TCGA数据筛选潜在的宫颈癌miRNA预后标志物
文献摘要：
目的 基于TCGA数据库中miRNA表达量及临床资料,寻找与宫颈癌患者生存相关的microRNA(miRNA or miR)生物标记物,构建模型以预测宫颈癌患者的生存期.方法 从TCGA数据库中提取出宫颈癌样本的miRNA表达及患者临床信息完整的数据,将样本随机分为训练集和验证集,通过统计学及生物信息学方法(Kaplan-Meier生存曲线、单因素Cox回归分析、Lasso回归、logRanK检验,多因素Cox回归建模,受试者工作特征曲线检验)筛选出与宫颈癌预后相关的miRNA.结果 在训练集中,通过单因素Cox生存分析,Lasso回归压缩建模得出5个miRNA与宫颈癌预后有关(P<0.05),多因素Cox回归分析表明在训练集和验证集中该模型都属于独立预后因素(P<0.05),ROC曲线表明该模型能够对预后做良好预判.基因本体论,通路,疾病富集分析都表明该模型中的miRNA标志物靶基因富集在与肿瘤相关的生物过程,通路,疾病上.结论 本研究构建的宫颈癌患者miRNA标志物预后模型,具有较好的可信性和特异性,对miRNA在宫颈癌预后判断具有较高借鉴作用.
文献关键词：
宫颈癌;生物信息学;miRNA;TCGA;预后标志物
中图分类号：
作者姓名：
苑飞艳;张新民;陈明珠;杨鸣;张立会
作者机构：
130051 吉林 长春,吉林大学第二医院妇产科;130021 吉林 长春,吉林大学药学院再生医学科学研究所
文献出处：
引用格式：
[1]苑飞艳;张新民;陈明珠;杨鸣;张立会-.基于TCGA数据筛选潜在的宫颈癌miRNA预后标志物)[J].中国计划生育和妇产科,2022(12):81-85,114
A类：
logRanK
B类：
TCGA,数据筛选,miRNA,预后标志物,宫颈癌患者,microRNA,or,生物标记物,构建模型,生存期,出宫,临床信息,训练集,验证集,生物信息学方法,Kaplan,Meier,生存曲线,Cox,Lasso,回归建模,受试者工作特征曲线,生存分析,独立预后因素,基因本体论,富集分析,靶基因,基因富集,肿瘤相关,生物过程,研究构建,预后模型,可信性,预后判断
AB值：
0.292633
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