典型文献
基于生物信息学预测肝细胞癌预后基因
文献摘要：
目的 基于生物信息学方法筛选肝癌预后基因以及探讨相关基因的作用机制.方法 基于TCGA-LIHC数据集、基因表达综合(GEO)数据库、Ualcan数据库研究了NUF2在肝癌组织和正常肝组织中的表达.采用Wilc-oxon秩和检验分析NUF2表达与肝癌临床病理特征的关系,生存分析采用Kaplan-Meier法,预后的单因素分析及多因素分析采用Cox比例风险回归模型.基于GO和KEGG通路富集分析探索其功能机制,利用STRING数据库进行NUF2蛋白互作网络构建,利用LinkedOmics数据库分析NUF2的互作基因以探究NUF2在肝癌发生中的调控机制.此外,使用TIMER数据库和CIBERSORT研究NUF2的表达与肿瘤浸润性免疫细胞状态的关系.结果 与正常肝组织相比,NUF2在肝细胞癌(HCC)组织中高表达,多变量Cox回归分析确定NUF2是HCC发生的独立危险因素,NUF2高表达患者的总生存期明显短于NUF2低表达的患者.另外,通过STRING数据库和LinkedOmics数据库构建了NUF2蛋白互作基因网络,功能分析显示NUF2及其相关基因主要参与核分裂、染色体分离、有丝分裂、化学诱导的癌变、细胞周期等过程.最后,在NUF2高表达的患者中,静息记忆CD4T细胞、活化记忆CD4T细胞、滤泡辅助T细胞、调节性T细胞(Treg)和M0巨噬细胞比例较高.结论 HCC组织中NUF2表达水平的上调在HCC发生发展中起关键作用,高表达的NUF2可作为鉴别早期和晚期HCC的潜在诊断和预后标志物,提高诊断及时性和预后准确性,NUF2在HCC肿瘤发生过程中的免疫机制中起着关键作用.
文献关键词：
NUF2;肝细胞癌;预后;生物标志物;肿瘤免疫
中图分类号：
作者姓名：
李琳琳;王凯
作者机构：
山东大学齐鲁医院肝病科,山东 济南250012
文献出处：
引用格式：
[1]李琳琳;王凯-.基于生物信息学预测肝细胞癌预后基因)[J].山东大学学报（医学版）,2022(05):50-58
A类：
Wilc,oxon
B类：
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AB值：
0.335997
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