典型文献
基于生物信息学分析CD93基因在肺鳞癌中的表达及其化疗敏感性和预后的关系
文献摘要：
目的:应用生物信息学方法探讨CD93基因在肺鳞癌组织中的表达情况,并分析CD93基因表达与化疗敏感性及患者预后的关系.方法:通过The Cancer Genome Atlas(TCGA)数据库比较CD93 mRNA在肺鳞癌患者与正常肺组织中的表达差异.采用基因集富集分析(GSEA)CD93免疫相关通路;采用单样本基因集富集分析(ssGSEA)肺鳞癌患者的CD93基因表达情况与肿瘤微环境免疫细胞浸润的关系;采用pRRophetic算法,以IC50值为指标预测CD93基因表达与化疗药物敏感性的关系,并考察其与肺鳞癌患者预后的关系.结果:与正常肺组织相比,CD93 mRNA在肺鳞癌组织中低表达;CD93高表达的肺鳞癌组织样本显著富集在干扰素α反应、干扰素γ反应等相关信号通路;在肺鳞癌组织中,CD93表达水平与浆细胞样树突状细胞、自然杀伤细胞、巨噬细胞、调节性T细胞、骨髓来源的抑制性细胞浸润水平呈正相关.同时,化疗敏感性表示在肺鳞癌组织中,对于紫杉醇、长春瑞滨、多西他赛、顺铂等化疗药物,高表达CD93组IC50值高于低表达组.Kaplan-Meier结果显示,CD93表达水平与患者预后密切相关(P<0.05).结论:CD93在肺鳞癌组织中低表达,对传统化疗药物敏感;且CD93参与免疫相关通路,可作为肺鳞癌新型分子标志物.
文献关键词：
肺鳞癌;CD93;免疫微环境;化疗敏感性;基因
中图分类号：
作者姓名：
郭荣;宋爱萍;岳文静;高业
作者机构：
巴彦淖尔市医院临床药学科,巴彦淖尔 015000
文献出处：
引用格式：
[1]郭荣;宋爱萍;岳文静;高业-.基于生物信息学分析CD93基因在肺鳞癌中的表达及其化疗敏感性和预后的关系)[J].中国合理用药探索,2022(07):25-31
A类：
CD93
B类：
生物信息学分析,肺鳞癌,化疗敏感性,生物信息学方法,癌组织,Cancer,Genome,Atlas,TCGA,数据库比较,肺组织,表达差异,基因集富集分析,免疫相关,相关通路,单样本,ssGSEA,肿瘤微环境,免疫细胞浸润,pRRophetic,IC50,指标预测,化疗药物,药物敏感性,低表达,干扰素,浆细胞样树突状细胞,自然杀伤细胞,巨噬细胞,调节性,骨髓来源的抑制性细胞,敏感性表,紫杉醇,长春瑞滨,多西他赛,顺铂,Kaplan,Meier,传统化,新型分子标志物,免疫微环境
AB值：
0.236306
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