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西沙永乐群岛海域弧菌的分离鉴定
文献摘要：
从西沙永乐群岛7个岛礁海域的海水中分离出47株弧菌,将47株菌株进行16S rDNA、HSP60和gyrB扩增,序列在Genebank中进行比对,构建系统发育树.结果 显示利用16S rDNA和HSP60序列比对均无法鉴定弧菌到种.gyrB1和gyrB2引物均只能扩增出6株菌株的目标序列,gyrB3引物能扩增47株菌株的目标序列,且成功构建系统发育树,可鉴定弧菌到种.47株弧菌菌株分属于7个种,鸭公岛弧菌多样性最丰富,可分离到5种;石屿和羚羊礁筐仔沙洲弧菌多样性最低,均只分离到2种.本研究建立了可靠的海洋弧菌的分子鉴定方法,获得的菌株丰富了南海微生物菌种库,可为今后的研究与教学提供材料.
文献关键词：
弧菌;鉴定;16S rDNA;HSP60;gyrB
中图分类号：
作者姓名：
张秀霞;张泽龙;李军涛;鲁耀鹏;郑佩华;冼健安
作者机构：
中国热带农业科学院热带生物技术研究所,海南省海洋生物资源功能性成分研究与利用重点实验室,海南海口571101;中国热带农业科学院海南热带农业资源研究院,海南海口571101
文献出处：
引用格式：
[1]张秀霞;张泽龙;李军涛;鲁耀鹏;郑佩华;冼健安-.西沙永乐群岛海域弧菌的分离鉴定)[J].渔业研究,2022(01):1-8
A类：
gyrB1,gyrB2,gyrB3
B类：
西沙,永乐,群岛,分离鉴定,岛礁海域,16S,rDNA,HSP60,Genebank,建系,系统发育树,序列比对,引物,目标序列,分属,鸭公,岛弧,可分离,羚羊,沙洲,海洋弧菌,分子鉴定,鉴定方法,南海,微生物菌,菌种
AB值：
0.363757
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