典型文献
禾本科植物基因家族数据库的构建研究
文献摘要：
禾本科的经济价值较高,部分禾本科植物相继完成基因组测序,并已有研究分析了多个基因家族调节禾本科植物生长发育过程和在响应各种逆境胁迫中发挥的作用,对于理解禾本科植物的生物学和进化具有重要意义.通过对29个禾本科物种62个基因家族的分析构建了一个在线数据库GGFDB.使用数据库在对禾本科植物基因家族分析中发现,禾本科物种中大部分基因家族扩增的动力来源于全基因组加倍事件,其次是串联重复.在基因家族基因数量统计中显示,大部分基因家族的基因个数在10～50个,也有部分大型基因家族的基因数量比较多,达到了100多个.在对基因家族氨基酸组成统计中发现,丙氨酸(A)的数量在各个基因家族中最多,色氨酸(W)和半胱氨酸(C)的数量在各个基因家族中比较少.通过保守基序分析,推测了二穗短柄草BES1基因家族中Motif1导致其功能的重要因素.本研究对进一步探索禾本科植物基因家族提供了指导,同时为禾本科和其他相关单子叶植物基因家族提供研究平台.
文献关键词：
禾本科;基因家族;数据库
中图分类号：
作者姓名：
杨启航;王希胤
作者机构：
华北理工大学,河北唐山063210
文献出处：
引用格式：
[1]杨启航;王希胤-.禾本科植物基因家族数据库的构建研究)[J].种子科技,2022(19):1-3
A类：
GGFDB
B类：
禾本科植物,植物基,基因组测序,植物生长发育,逆境胁迫,使用数据,基因家族分析,动力来源,全基因组,加倍,家族基因,数量比较,氨基酸组成,丙氨酸,色氨酸,中比,保守基序,二穗短柄草,BES1,Motif1,单子叶植物,研究平台
AB值：
0.235798
相似文献
机标中图分类号，由域田数据科技根据网络公开资料自动分析生成，仅供学习研究参考。
