典型文献
鼻咽癌同期放化疗抵抗细胞株与母细胞株lncRNA的差异表达谱分析
文献摘要：
目的 分析鼻咽癌同期放化疗抵抗细胞株与亲本细胞株间差异表达的长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA),探索lncRNA在鼻咽癌同期放化疗抵抗中可能发挥的作用.方法 体外构建鼻咽癌CEN1和CNE2细胞同期放化疗抵抗模型,诱导鼻咽癌细胞同期放化疗抵抗细胞株CEN1CRR和CNE2CRR,应用高通量测序筛选2组细胞株间差异表达的lncRNAs,对差异表达的lncRNAs的靶基因进行GO和KEGG分析.结果 以Log2FC＞1或＜-1,FDR＜0.05为差异表达标准,和CNE1相比,CNE1CRR差异表达的lncRNAs2746个(358个上调,2063个下调);和CNE2相比,CNE2CRR差异表达的lncRNAs3475个(265个上调,520个下调);此外,387个lncRNAs在CNE1CRR和CNE2CRR中表达同时下调,49个lncRNAs在CNE1CRR和CNE2CRR中同时上调.在GO分析中发现,2组细胞中差异表达lncRNAs的靶基因在生物过程(biological process,BP)、分子功能(molecular function,MF)、细胞成分(cellular component,CC)等方面均有参与.在KEGG分析结果中发现,CNE1组细胞中,差异lncRNAs的靶基因主要富集的信号通路有细胞凋亡、病毒致癌、代谢途径等.CNE2组细胞中,差异lncRNAs的靶基因主要富集的信号通路有代谢途径(硫辛酸、磷酸戊糖、花生四烯酸、醚脂质)、T细胞受体信号通路、核苷酸切除修复等(P＜0.05).结论 同期放化疗抵抗细胞株与亲本细胞株的lncRNA表达谱存在明显差异,这些差异表达的lncRNA可能参与了鼻咽癌的同期放化疗抵抗,并为其机制研究奠定基础.
文献关键词：
长链非编码RNA(lncRNA);表达谱;鼻咽癌细胞;同期放化疗抵抗;高通量测序
中图分类号：
作者姓名：
刘秋燕;熊伟;李程
作者机构：
云南省肿瘤医院/昆明医科大学第三附属医院放射治疗中心,云南昆明 650118;攀枝花学院附属医院肿瘤科,四川 攀枝花 617000
文献出处：
引用格式：
[1]刘秋燕;熊伟;李程-.鼻咽癌同期放化疗抵抗细胞株与母细胞株lncRNA的差异表达谱分析)[J].昆明医科大学学报,2022(11):77-84
A类：
同期放化疗抵抗,CEN1,CEN1CRR,CNE2CRR,CNE1CRR,lncRNAs2746,lncRNAs3475
B类：
细胞株,母细胞,差异表达,表达谱分析,亲本,株间差异,长链非编码,long,coding,体外构建,鼻咽癌细胞,靶基因,Log2FC,FDR,时下,生物过程,biological,process,molecular,function,MF,细胞成分,cellular,component,CC,致癌,代谢途径,硫辛酸,戊糖,花生四烯酸,细胞受体,核苷酸切除修复
AB值：
0.142456
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