典型文献
基于网络药理学与分子对接探究宁心通郁滋肾方治疗早发性卵巢功能不全的作用机制
文献摘要:
[目的]基于四级杆-静电轨道阱(Q exactive orbitrap,Q-Orbitrap)高分辨液质联用系统分析结果,利用网络药理学结合分子对接的方法探究宁心通郁滋肾方治疗早发性卵巢功能不全(premature ovarian insufficiency,POI)的作用机制.[方法]采用Q-Orbitrap高分辨液质联用系统分析宁心通郁滋肾方中的活性成分,再通过Swiss Target Prediction数据库获取方中活性成分的靶点.利用基因组注释数据平台(Genome Annotation Database Platform,GeneCard)和在线人类孟德尔遗传(Online Mendelian Inheritance in Man,OMIM)数据库获取POI的疾病靶点.在String平台构建交集靶点的蛋白互作(protein-protein interaction,PPI)网络后,通过Cytoscape 3.8.2软件筛选关键靶点,并构建"关键靶点-关键活性成分"网络,筛选主要关键活性成分.通过生物学信息注释数据库(the Database for Annotation,Visualization and Integrated Discovery,DAVID)进行基因本体(gene ontology,GO)和京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)富集分析.利用Surflex-Dock分子对接程序进行分子对接,获取对接分数(total score).[结果]共获得有效活性成分71种,有效活性成分的作用靶点807个,POI疾病靶点1143个,交集靶点176个.经分析得到信号转导和转录激活因子3(signal transducer and activator of transcription 3,STAT3)、类固醇受体共激活因子(steroid receptor coactivator,SRC)、蛋白激酶B1(protein kinase B1,AKT1)、90kDa热休克蛋白αA1(heat shock protein 90kDaαA1,HSP90AA1)等39个关键靶点及54种关键活性成分.富集分析结果显示,关键靶点主要涉及凋亡过程的负调控、一氧化氮生物合成过程的正调控、蛋白磷酸化的正调控等生物过程及癌症、癌症中的蛋白聚糖、乙型肝炎等信号通路.分子对接结果提示,槲皮素(Quercetin)作为方中最关键的活性成分与对应关键靶点的对接均较稳定.[结论]宁心通郁滋肾方可能通过槲皮素、异鼠李素、瑟丹内酯等关键活性成分,作用于STAT3、SRC、AKT1等靶点,通过缓解氧化应激、修复氧化损伤,改善卵巢功能,治疗POI.
文献关键词:
宁心通郁滋肾方;早发性卵巢功能不全;四级杆-静电轨道阱高分辨液质联用系统;网络药理学;分子对接;作用机制;槲皮素;信号转导和转录激活因子3
中图分类号:
作者姓名:
马佳文;李想;张翼宙
作者机构:
浙江中医药大学 杭州 310053
文献出处:
引用格式:
[1]马佳文;李想;张翼宙-.基于网络药理学与分子对接探究宁心通郁滋肾方治疗早发性卵巢功能不全的作用机制)[J].浙江中医药大学学报,2022(03):252-263
A类:
宁心通郁滋肾方,exactive
B类:
网络药理学与分子对接,早发性卵巢功能不全,四级,orbitrap,Orbitrap,液质联用,联用系统,利用网络,方法探究,premature,ovarian,insufficiency,POI,Swiss,Target,Prediction,基因组注释,Annotation,Database,Platform,GeneCard,线人,孟德尔遗传,Online,Mendelian,Inheritance,Man,OMIM,String,平台构建,建交,交集靶点,蛋白互作,protein,interaction,PPI,Cytoscape,选关,关键靶点,关键活性成分,选主,注释数据库,Visualization,Integrated,Discovery,DAVID,基因本体,gene,ontology,京都基因与基因组百科全书,Kyoto,Encyclopedia,Genes,Genomes,富集分析,Surflex,Dock,对接程序,total,score,共获,得有,作用靶点,信号转导和转录激活因子,signal,transducer,transcription,STAT3,类固醇,共激活,steroid,receptor,coactivator,SRC,蛋白激酶,B1,kinase,AKT1,90kDa,热休克蛋白,heat,shock,HSP90AA1,负调控,一氧化氮,生物合成,合成过程,正调控,蛋白磷酸化,生物过程,蛋白聚糖,乙型肝炎,槲皮素,Quercetin,异鼠李素,内酯,复氧,氧化损伤
AB值:
0.387238
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