典型文献
中华猕猴桃根抗肝癌分子调控机制研究
文献摘要：
目的 探讨中华猕猴桃根治疗肝癌的潜在作用靶点及信号通路.方法 收集癌症基因组图谱数据库(TCGA)和国际癌症基因组联合体数据库(ICGC)截至2021年12月收录的肝癌患者肿瘤组织、正常肝组织的转录组数据及临床信息.代谢相关基因来自MSigDB数据库和Gene Cards数据库.筛选中华猕猴桃根的有效活性成分及靶点.利用R 4.1.1软件获得肝癌组织中差异表达的代谢基因.将差异代谢基因与中华猕猴桃根活性成分的靶基因做交集处理,获得交集基因.交集基因进行GO功能富集分析、KEGG通路富集分析.通过Cytoscape 3.9.0软件建立"中华猕猴桃根药效成分-靶点-疾病"的网络,获取节点的度值较大的靶点.利用vina软件进行分子对接,运用PyMOL软件对结合能的绝对值较大的对接结果进行可视化.结果 最终筛选出15种中华猕猴桃根有效成分化合物,涉及靶点基因326个.MSigDB数据库和Gene Cards数据库最终筛选出321个差异表达的代谢基因,与326个靶点基因进行交集映射,得到ACACA、ACSL4、AKR1C3、CYP1A2、CYP2C19等表达上调或下调的20个抗癌基因.药物活性成分-靶点网络构建结果显示,节点主要涉及槲皮素、山奈酚、β-谷甾醇等13种活性成分,对应ACACA、ACSL4、AKR1C3、CYP1A2、CYP2C19、CYP2C9等20个潜在靶点.GO富集分析结果显示,其生物学过程主要在脂肪酸代谢过程、长链脂肪酸代谢过程、不饱和脂肪酸代谢过程、烯烃化合物代谢过程、脂肪酸生物合成过程等.KEGG通路富集分析结果显示,信号通路主要涉及化学致癌作用-DNA加合物、花生四烯酸代谢、亚油酸代谢、药物代谢-细胞色素P450等.分子对接共涉及9个代谢途径,POLD1、AKR1C3、CYP2C9、ACACA共4个靶点基因,槲皮素、山奈酚2种有效成分,槲皮素-POLD1、山奈酚-AKR1C3、槲皮素-CYP2C9具有较好的结合活性.结论 槲皮素和山奈酚可能是中华猕猴桃根干预肝癌细胞代谢重编过程中起主要活性的药效成分,其可能通过作用于AKR1C3、CYP2C9、ACACA、POLD1这4个靶点,参与调节肿瘤细胞中的代谢重编过程.
文献关键词：
肝癌;中华猕猴桃根;网络药理学;分子对接;作用机制
中图分类号：
作者姓名：
孙庆庆;陈晓泉;陈潞君;曲美霖;李京
作者机构：
联勤保障部队临潼康复疗养中心,陕西西安710600;陕西省肿瘤医院中西医科,陕西西安710061;中国医科大学,辽宁 沈阳110122;沈阳药科大学,辽宁 沈阳110016;辽宁中医药大学,辽宁 沈阳110032
文献出处：
引用格式：
[1]孙庆庆;陈晓泉;陈潞君;曲美霖;李京-.中华猕猴桃根抗肝癌分子调控机制研究)[J].临床军医杂志,2022(07):733-737
A类：
中华猕猴桃根,抗癌基因
B类：
抗肝癌,分子调控机制,潜在作用,作用靶点,癌症基因组图谱数据库,TCGA,联合体,ICGC,肝癌患者,肿瘤组织,肝组织,转录组数据,临床信息,代谢相关基因,MSigDB,Gene,Cards,选中,肝癌组织,差异表达,代谢基因,靶基因,交集,功能富集分析,通路富集分析,Cytoscape,药效成分,vina,分子对接,PyMOL,结合能,有效成分,靶点基因,ACACA,ACSL4,AKR1C3,CYP1A2,CYP2C19,药物活性成分,靶点网络,网络构建,槲皮素,山奈酚,谷甾醇,CYP2C9,潜在靶点,生物学过程,脂肪酸代谢,代谢过程,长链脂肪酸,不饱和脂肪酸,烯烃化,生物合成,合成过程,致癌,加合物,花生四烯酸代谢,亚油酸代谢,药物代谢,细胞色素,P450,代谢途径,POLD1,结合活性,肝癌细胞,细胞代谢,代谢重编,编过,肿瘤细胞,网络药理学
AB值：
0.260866
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