典型文献
基于ceRNA网络构建和免疫细胞浸润的肾乳头状细胞癌新预后特征分析
文献摘要：
目的 通过构建肾乳头状细胞癌(PRCC)相关ceRNA网络并进行分析,同时联合免疫细胞浸润,寻找新的PRCC治疗靶点和预后标志物.方法 从癌症基因组图谱(TCGA)数据库下载PRCC相关基因及其临床数据,并利用R软件筛选出差异表达的RNA分子构建ceRNA网络.进行单因素Cox分析、lasso回归分析以及多因素Cox分析筛选出与预后相关的基因并构建基因风险模型.通过CIBERSORT算法对免疫细胞进行评估,去除所有表达量为0的免疫细胞并对其进行单因素Cox分析、lasso回归分析以及多因素Cox分析,筛选出与预后相关的免疫细胞构建免疫细胞风险模型.最后将基因风险模型和免疫细胞风险模型进行共表达分析.结果 经过筛选后,我们发现了 11个重要的基因以及2个重要的免疫细胞,分别为ELN、COL1A1、EFEMP1、SYNGR3、DBT、KCTD15、RNF149、IKBIP、ATAD5、TCF4和 hsa-miR-133a-3p 这 11 个基因,以及巨噬细胞 M0和活化的CD4+记忆T细胞;共表达分析中,发现DBT与巨噬细胞M0(R=0.22,P=0.045)、TCF4与活化的CD4+记忆T细胞(R=0.37,P＜0.001)呈正相关.结论 筛选出的11个基因和2个免疫细胞是PRCC患者新的潜在治疗靶点以及预后标志物,共表达分析发现DBT与巨噬细胞M0、TCF4与活化的CD4+记忆T细胞呈正相关.
文献关键词：
肾乳头状细胞癌;ceRNA网络;免疫细胞浸润;预后标志物;治疗靶点;基因
中图分类号：
作者姓名：
薛津;贾微微;白丽娜;牛晓辰;王晓晖;王丽
作者机构：
山西医科大学基础医学院病理教研室,山西太原 030001
文献出处：
引用格式：
[1]薛津;贾微微;白丽娜;牛晓辰;王晓晖;王丽-.基于ceRNA网络构建和免疫细胞浸润的肾乳头状细胞癌新预后特征分析)[J].现代泌尿外科杂志,2022(05):423-428,434
A类：
SYNGR3,KCTD15,RNF149,IKBIP,ATAD5
B类：
ceRNA,网络构建,免疫细胞浸润,肾乳头状细胞癌,PRCC,联合免疫,治疗靶点,预后标志物,癌症基因组图谱,TCGA,下载,临床数据,出差,差异表达,Cox,lasso,风险模型,CIBERSORT,共表达,表达分析,过筛,ELN,COL1A1,EFEMP1,DBT,TCF4,hsa,miR,133a,3p,巨噬细胞,M0,CD4+,潜在治疗
AB值：
0.248601
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