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典型文献
基于癌症基因组图谱数据库结直肠癌免疫细胞浸润预测模型的建立
文献摘要:
目的:研究结直肠癌组织的免疫细胞浸润与临床预后之间的相关性.方法:从癌症基因组图谱(the can-cer genome atlas,TCGA)中提取结直肠癌数据,基于反卷积算法(CIBERSORT)分析评估结直肠癌组织中22种肿瘤浸润性免疫细胞(tumor-infiltrating immune cells,TIICs)的浸润模式,以确定不同TIICs表达程度与5年生存率之间的关联.使用条形图展示结直肠癌样本中TIICs比例,绘制矩阵图分析不同TIICs之间的相关性.结果:共从TCGA数据库中提取了 473例结直肠癌组织和41个正常对照组织,对比分析表明,结直肠癌组织中各种TIICs比例存在差异.在研究的细胞亚群中,结直肠癌组织中M0、M1和M2巨噬细胞和单核细胞的比例相对较高,而B细胞和中性粒细胞的比例相对较低.TIICs的比例与患者的TNM分期及临床分级显著相关:静息NK细胞、CD8+T细胞、浆细胞与T期相关,活化树突状细胞与N期相关,嗜酸性粒细胞、M1巨噬细胞及活化肥大细胞与M期相关,M1巨噬细胞和单核细胞与临床分级相关.生存分析结果显示,活化的树突状细胞与结直肠癌患者的5年生存率呈正相关,幼稚CD4+T细胞与5年生存率呈负相关.结论:分析结直肠癌患者肿瘤组织TIICs亚群比例具有潜在的临床预后价值,可通过其识别可能从化疗中受益的患者,并预测新药的可能靶点.
文献关键词:
淋巴细胞;肿瘤浸润;结直肠肿瘤;基因数据库;列线图;临床病理特征
作者姓名:
丁婷婷;曾楚雄;胡丽娜;余明华
作者机构:
上海市浦东医院,复旦大学附属浦东医院肿瘤科,上海 201399
引用格式:
[1]丁婷婷;曾楚雄;胡丽娜;余明华-.基于癌症基因组图谱数据库结直肠癌免疫细胞浸润预测模型的建立)[J].北京大学学报(医学版),2022(02):203-208
A类:
B类:
癌症基因组图谱数据库,免疫细胞浸润,结直肠癌组织,临床预后,can,cer,genome,atlas,TCGA,反卷积算法,CIBERSORT,分析评估,肿瘤浸润性免疫细胞,tumor,infiltrating,immune,cells,TIICs,浸润模式,条形图,矩阵图,正常对照,细胞亚群,M0,M1,M2,巨噬细胞,单核细胞,TNM,临床分级,静息,NK,CD8+T,浆细胞,树突状细胞,嗜酸性粒细胞,化肥,肥大细胞,生存分析,结直肠癌患者,幼稚,CD4+T,肿瘤组织,预后价值,从化,新药,结直肠肿瘤,基因数据库,列线图,临床病理特征
AB值:
0.277324
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