典型文献
正常与氧糖剥夺再复氧培养的星形胶质细胞来源外泌体miRNA测序分析
文献摘要:
本研究通过高通量测序技术,分析正常培养和氧糖剥夺再复氧(oxygen and glucose deprivation/reoxygenation,OGD/R)培养星形胶质细胞来源外泌体的差异微小RNA(microRNA,miRNA).采用超速离心法提取正常组和OGD/R组星形胶质细胞培养基上清的外泌体,透射电镜观察到提取的外泌体呈典型囊泡状,包膜完整,含有低电子密度的物质;纳米颗粒追踪技术(NTA)检测到星形胶质细胞外泌体大小为100.5±31.1 nm,占比为96.8%;免疫印迹检测显示,提取物中有外泌体标志性蛋白肿瘤易感蛋白(tumour-susceptibility protein,TSG101)、热休克蛋白60(heat shock proteins 60,Hsp60)、ALG-2相互作用蛋白 X(ALG-2-interacting protein X,ALIX)的表达.与正常组相比,OGD/R组共有41个miRNA发生显著改变,其中20个miRNA显著升高,21个miRNA显著降低(P<0.05).基因本体功能(GO)分析显示,差异靶基因主要参与蛋白质糖基化、脂质代谢过程、磷酸化作用、高尔基体、内质网、内吞体、细胞质囊泡和细胞突起等生物学过程;京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路分析发现,差异靶基因主要与丁酸代谢、β-丙氨酸代谢、脂肪酸降解、线粒体自噬和P53信号通路等代谢途径和信号通路有关.通过对正常组和OGD/R组的星形胶质细胞来源的外泌体miRNA测序并进一步施行靶基因功能富集分析,为后续研究星形胶质细胞外泌体对氧糖剥夺再灌注神经元发挥的保护作用的具体机制提供了一定的研究基础.
文献关键词:
氧糖剥夺再灌注;星形胶质细胞;外泌体;高通量测序技术;微小RNA
中图分类号:
作者姓名:
龙培艳;张文萍;郑菊;付燕林;高霄;王正薇;肖雁
作者机构:
地方病与少数民族疾病教育部重点实验室,贵阳550004;贵州医科大学分子生物学重点实验室,贵阳550004
文献出处:
引用格式:
[1]龙培艳;张文萍;郑菊;付燕林;高霄;王正薇;肖雁-.正常与氧糖剥夺再复氧培养的星形胶质细胞来源外泌体miRNA测序分析)[J].中国生物化学与分子生物学报,2022(03):356-364
A类:
星形胶质细胞外泌体
B类:
氧糖剥夺再复氧,miRNA,测序分析,高通量测序技术,glucose,deprivation,reoxygenation,OGD,microRNA,超速离心法,细胞培养,上清,透射电镜,电镜观察,囊泡,泡状,包膜,电子密度,纳米颗粒追踪,追踪技术,NTA,免疫印迹,tumour,susceptibility,TSG101,热休克蛋白,heat,shock,proteins,Hsp60,ALG,相互作用蛋白,interacting,ALIX,基因本体,靶基因,蛋白质糖基化,脂质代谢,代谢过程,磷酸化,酸化作用,高尔基体,内质网,内吞,细胞质,细胞突起,生物学过程,京都基因与基因组百科全书,通路分析,丁酸,酸代谢,丙氨酸,线粒体自噬,P53,代谢途径,基因功能,功能富集分析,氧糖剥夺再灌注,具体机制
AB值:
0.32954
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