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二代测序技术检测临床痰标本中结核分枝杆菌的初步评价
文献摘要:
目的:评价二代测序(NGS)技术对临床痰标本中结核分枝杆菌的检测效能.方法:采用前瞻性研究方法,选取北京市疾病预防控制中心(北京结核病控制研究与防治所)2021年8-10月接诊的49例疑似肺结核患者痰标本,同时进行抗酸杆菌涂片镜检(简称"涂片")、分枝杆菌培养(包含罗氏培养和MGIT 960液体培养;简称"培养")、GeneXpert MTB/RIF(简称"Xpert")和NGS技术检测结核分枝杆菌,比较4种方法检测不同分类患者阳性率差异,并以最终临床诊断为参照标准,评价4种检测方法的检测效能.结果:49例疑似肺结核患者中,最终肺结核诊断者40例(包括病原学确诊患者25例、病原学阴性临床诊断患者15例),非肺结核患者9例(包括肺炎6例,非结核分枝杆菌感染、慢性阻塞性肺疾病和哮喘各1例).NGS技术检测49例疑似肺结核患者的阳性率[69.4%(34/49)]明显高于涂片[44.9%(22/49)]、培养[51.0%(25/49)]和 Xpert[49.0%(24/49)],差异均有统计学意义(x2=17.614、17.018、20.753,P值均=0.000);检测病原学阴性肺结核患者的阳性检出率为46.7%(7/15).以临床诊断结果为参照标准,涂片、培养、Xpert、NGS技术对49例疑似患者痰标本的检测敏感度分别为55.0%(22/40)、60.0%(24/40)、60.0%(24/40)、80.0%(32/40),特异度分别为 9/9、8/9、9/9、7/9,一致率分别为63.3%(31/49)、65.3%(32/49)、67.3%(33/49)、79.6%(39/49),Kappa 值分别为 0.310、0.297、0.355、0.459.结论:以临床诊断为参考标准,NGS技术检测的敏感度最高,与临床诊断的一致性也最高,能够快速、高效检测痰标本中的结核分枝杆菌,可早期辅助诊断疑似肺结核患者.
文献关键词:
分枝杆菌;结核;诊断技术和方法;对比研究
中图分类号:
作者姓名:
代小伟;王嫩寒;陈双双;杨新宇;田丽丽;陈红;张泓泰;李传友
作者机构:
北京市疾病预防控制中心(北京结核病控制研究与防治所),北京100035;中国科学院生物物理研究所,北京100101;中国农业科学院原子能利用研究所,北京100193
文献出处:
引用格式:
[1]代小伟;王嫩寒;陈双双;杨新宇;田丽丽;陈红;张泓泰;李传友-.二代测序技术检测临床痰标本中结核分枝杆菌的初步评价)[J].中国防痨杂志,2022(07):669-674
A类:
B类:
二代测序技术,痰标本,初步评价,NGS,前瞻性研究,疾病预防控制中心,结核病控制,防治所,接诊,疑似肺结核,肺结核患者,抗酸杆菌,涂片镜检,罗氏,MGIT,液体培养,GeneXpert,MTB,RIF,病原学阴性,非结核分枝杆菌,结核分枝杆菌感染,慢性阻塞性肺疾病,哮喘,x2,阳性检出率,诊断结果,疑似患者,一致率,Kappa,参考标准,高效检测,早期辅助诊断,诊断技术和方法
AB值:
0.232699
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