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基于整合药理学和转录组学的天龙咳喘灵抗特发性肺动脉高压可行性分析及作用机制
文献摘要：
目的 基于整合药理学和转录组学探究天龙咳喘灵抗特发性肺动脉高压(IPAH)的可行性及作用机制.方法 通过TCMSP、本草组鉴(HERB)数据库收集天龙咳喘灵活性成分,利用SwissTargetPrediction、HERB数据库查找活性成分对应靶点,利用GeneCards、DisGeNET数据库获取IPAH疾病靶点;通过OmicShare在线平台构建维恩图,得到天龙咳喘灵抗IPAH关键靶点;利用Cytoscape3.8.0软件构建药物-成分-疾病-靶点网络,依据度值筛选核心成分;利用STRING数据库得到关键靶点蛋白相互作用网络,导入Cytoscape3.8.0软件进行网络拓扑学分析,结合药物-成分-疾病-靶点网络进一步筛选出核心靶点;通过R clusterProfiler 3.16.1对关键靶点进行GO和KEGG通路富集分析;运用殷赋科技在线平台、AutoDock4.2.6、PyMOL2.4软件进行分子对接;使用xCell评分估计IPAH肺组织的差异细胞类型,并分析其与核心靶点的相关性.结果 得到天龙咳喘灵活性成分160种、IPAH疾病靶点86个;核心成分包括槲皮素、腺苷、熊果酸等9种,核心靶点包括PTGS2、NOS2、ADRB2和VEGFA;GO富集分析筛选得到925个生物过程、11个细胞组分、22个分子功能条目,KEGG通路富集分析得到48条通路;分子对接结果显示,核心成分与核心靶点几乎均可自发结合,其中熊果酸与核心靶点的平均结合能最小,结合活性最好;相关性分析结果表明,PTGS2和VEGFA与多种细胞类型显著相关.结论 本研究从整合药理学和转录组学角度初步阐明天龙咳喘灵抗IPAH多成分、多靶点、多途径的整体调节特点,与微阵列芯片验证结果基本相符,可为后续药理学研究和临床应用提供依据与参考.
文献关键词：
天龙咳喘灵;特发性肺动脉高压;网络药理学;分子对接;转录组学
中图分类号：
作者姓名：
林范杰;李东蕾;林肯;陈少琪;卢文菊
作者机构：
呼吸疾病国家重点实验室,国家呼吸系统疾病临床医学研究中心,广州呼吸健康研究院,广州医科大学附属第一医院,广东 广州 510030;广州医科大学,广东 广州 510030
文献出处：
引用格式：
[1]林范杰;李东蕾;林肯;陈少琪;卢文菊-.基于整合药理学和转录组学的天龙咳喘灵抗特发性肺动脉高压可行性分析及作用机制)[J].中国中医药信息杂志,2022(10):30-39
A类：
天龙咳喘灵,PyMOL2
B类：
整合药理学,转录组学,特发性肺动脉高压,可行性分析,IPAH,TCMSP,本草,HERB,活性成分,SwissTargetPrediction,GeneCards,DisGeNET,OmicShare,在线平台,平台构建,维恩图,关键靶点,Cytoscape3,软件构建,靶点网络,核心成分,STRING,靶点蛋白,蛋白相互作用网络,网络拓扑学分析,核心靶点,clusterProfiler,通路富集分析,AutoDock4,分子对接,xCell,肺组织,细胞类型,分包,槲皮素,腺苷,熊果酸,PTGS2,NOS2,ADRB2,VEGFA,选得,生物过程,条目,发结,平均结合能,结合活性,明天,多成分,多靶点,多途径,整体调节,微阵列芯片,芯片验证,药理学研究,网络药理学
AB值：
0.295543
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