首站-论文投稿智能助手
典型文献
基于网络药理学和生物信息学的小青龙汤治疗哮喘和慢性阻塞性肺疾病的"异病同治"机制分析
文献摘要:
目的 基于网络药理学与生物信息学研究方法,探讨小青龙汤治疗慢性阻塞性肺疾病(chronic obstructive pulmonary disease,COPD)和哮喘"异病同治"的疗效及其作用机制.方法 通过ETCM数据库、DisGeNET数据库、GeneCards数据库、OMIM数据库搜集小青龙汤治疗COPD和哮喘的作用靶点.通过STRING 11.0分析作用靶点之间的相互关系,运用cytoNCA和MCODE插件筛选出核心作用靶点.使用ClueGO和DAVID数据库对作用靶点进行KEGG通路富集分析和GO功能分析.在GEO数据库下载COPD和哮喘的基因芯片,运用R语言sav包去批次效应后验证核心作用靶点是否差异表达,并对差异表达明显的核心靶点进行分子对接验证.结果 共筛选出小青龙汤治疗COPD和哮喘的作用靶点95个,筛选出19个核心作用靶点.富集分析结果显示共涉及82条信号通路及120种生物过程、16种分子功能、21种细胞组分.GEO芯片验证显示NR3C1、HSP90AA1、TNF、CASP3、AKT1、PTGS2、TLR4、EGF、IL1B、HRAS在COPD和哮喘与健康样本之间具有明显的表达差异,绘制中药-化合物-靶点网络图后,进一步对Degree值前5的靶点进行分子对接,结果显示活性成分与关键靶点有良好的亲和力.结论 小青龙汤主要通过NR3C1、HSP90AA1、TNF、CASP3、AKT1、PTGS2、TLR4、EGF、IL1B、HRAS等多靶点和TNF信号通路、Toll样受体信号通路等途径发挥对COPD与哮喘"异病同治"作用.
文献关键词:
小青龙汤;慢性阻塞性肺疾病;哮喘;网络药理学;GEO数据库;分子对接
作者姓名:
翟芬芬;刘毓菲;张传涛;杨洋;黄青松;高培阳;陈新
作者机构:
深圳市福田区慢性病防治院,广东 深圳 518000;成都中医药大学附属医院呼吸科,四川 成都 610072;成都中医药大学附属医院重症医学科,四川 成都 610072;自贡市第一人民医院中西医结合科,四川 自贡 643000
引用格式:
[1]翟芬芬;刘毓菲;张传涛;杨洋;黄青松;高培阳;陈新-.基于网络药理学和生物信息学的小青龙汤治疗哮喘和慢性阻塞性肺疾病的"异病同治"机制分析)[J].湖南中医药大学学报,2022(06):958-965
A类:
cytoNCA
B类:
网络药理学,小青龙汤,哮喘,慢性阻塞性肺疾病,异病同治,机制分析,生物信息学研究,chronic,obstructive,pulmonary,disease,COPD,ETCM,DisGeNET,GeneCards,OMIM,作用靶点,STRING,MCODE,插件,核心作用,ClueGO,DAVID,通路富集分析,功能分析,GEO,下载,基因芯片,sav,包去,批次效应,差异表达,核心靶点,分子对接,生物过程,芯片验证,NR3C1,HSP90AA1,CASP3,AKT1,PTGS2,TLR4,EGF,IL1B,HRAS,表达差异,靶点网络,网络图,Degree,活性成分,关键靶点,亲和力,多靶点,Toll,样受体
AB值:
0.334606
相似文献
机标中图分类号,由域田数据科技根据网络公开资料自动分析生成,仅供学习研究参考。