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典型文献
基于网络药理及分子对接分析《普济方》痤疮外治古方特色角药作用机制
文献摘要:
目的 基于网络药理学和分子对接分析《普济方》痤疮外治古方特色角药的作用机制.方法 利用TCMSP和TCMID筛选《普济方》痤疮外治古方特色角药的有效成分和作用靶点,通过UniProt数据库注释靶点基因;通过DisGeNET、DrugBank、GeneCards、OMIM数据库获取痤疮疾病靶点;将药物靶点与疾病靶点取交集,运用R语言通过Bioconductor数据库对交集靶点进行GO-BP及KEGG通路富集分析;通过STRING数据库对交集靶点进行蛋白相互作用(PPI)分析,利用Cytoscape3.8.2软件MCODE插件对PPI网络进行聚类,获得关键靶点.通过AutoDock Tools 1.5.6软件对关键靶蛋白受体和化合物配体进行分子对接验证.结果 筛选得到《普济方》痤疮外治古方特色角药有效成分37个,药物与疾病交集靶点23个.GO富集分析结果显示,特色角药参与核受体活性、类固醇激素受体活性、配体激活转录因子活性、类固醇结合等生物学过程;KEGG通路富集分析结果显示,特色角药以雌激素信号通路为代表的类固醇类性激素信号调控通路为主要调控作用途径.分子对接结果表明,特色角药4个关键化合物杨梅酮、异紫花前胡内酯、p-谷甾醇、别欧前胡素与4个靶蛋白雄激素受体、雌激素受体、孕酮受体、前列腺素G/H合成酶2均存在较强的结合作用,β-谷甾醇和雄激素受体结合所需的能量最低,结合性最强.结论 《普济方》痤疮外治古方特色角药对痤疮的干预作用具有多成分、多靶点、多通路、全环节的调控特点,可能通过抗雄、抗炎、免疫调节、脂代谢调节、抗增殖发挥治疗作用.
文献关键词:
普济方;痤疮外治方;网络药理学;分子对接;作用机制
作者姓名:
张益生;邓诗航;张君冬;李宗友;宋坪
作者机构:
中国中医科学院中医药信息研究所,北京100700;中国中医科学院广安门医院,北京100053;国家中医药管理局监测统计中心,北京100027
引用格式:
[1]张益生;邓诗航;张君冬;李宗友;宋坪-.基于网络药理及分子对接分析《普济方》痤疮外治古方特色角药作用机制)[J].中国中医药信息杂志,2022(09):26-33
A类:
痤疮外治方
B类:
分子对接,普济方,古方,角药,网络药理学,TCMSP,TCMID,有效成分,作用靶点,UniProt,靶点基因,DisGeNET,DrugBank,GeneCards,OMIM,药物靶点,Bioconductor,交集靶点,通路富集分析,STRING,蛋白相互作用,PPI,Cytoscape3,MCODE,插件,关键靶点,AutoDock,Tools,靶蛋白,选得,核受体,类固醇激素,生物学过程,雌激素信号通路,醇类,类性激素,信号调控,调控通路,作用途径,杨梅,紫花,内酯,谷甾醇,欧前胡素,雄激素受体,雌激素受体,孕酮受体,前列腺素,合成酶,醇和,结合性,药对,干预作用,多成分,多靶点,多通路,免疫调节,脂代谢,代谢调节,抗增殖,治疗作用
AB值:
0.326126
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