典型文献
基于GEO数据挖掘与网络药理学探讨活血化瘀方治疗口腔扁平苔藓的机制研究
文献摘要：
基于GEO数据库挖掘OLP的潜在治疗靶点,基于网络药理学分析活血化瘀方治疗OLP的主要化学成分、潜在作用靶点与治疗机制.采用R语言爬取GEO数据库中GSE52130数据集,通过差异分析得出OLP的异常表达基因;基于TCMSP数据库获取活血化瘀方中相关化学成分与靶点,利用Perl、Cytoscape软件和String绘制该药方成分-靶点网络与蛋白-蛋白互作网络;通过R语言完成关键靶基因的基因本体论(GO)分析与基因组百科全书(KEGG)分析.结果表明:活血化瘀方治疗OLP的关键化学成分共28个,包括槲皮素、山奈酚、豆甾醇等;核心作用靶点共13个,包括IL-1β、PTGS2(COX-2)、MAO等.KEGG分析发现活血化瘀方可影响神经递质代谢、巨细胞病毒感染、AGE-RAGE等通路,为后续中医药治疗口腔扁平苔藓的深入研究提供理论参考.
文献关键词：
活血化瘀方;口腔扁平苔藓;网络药理学;作用靶点;治疗机制
中图分类号：
作者姓名：
杨倩;赖仁发;刘湘宁
作者机构：
暨南大学附属第一医院口腔医疗中心 广东 广州 510630;暨南大学口腔交叉学科临床研究平台 广东 广州 510630;暨南大学口腔医学院 广东 广州 510632
文献出处：
引用格式：
[1]杨倩;赖仁发;刘湘宁-.基于GEO数据挖掘与网络药理学探讨活血化瘀方治疗口腔扁平苔藓的机制研究)[J].口腔医学研究,2022(05):465-470
A类：
GSE52130
B类：
GEO,网络药理学,活血化瘀方,口腔扁平苔藓,OLP,潜在治疗,治疗靶点,药理学分析,主要化学成分,潜在作用,作用靶点,治疗机制,爬取,异常表达,表达基因,TCMSP,Perl,Cytoscape,String,该药,药方,方成,靶点网络,蛋白互作网络,关键靶基因,基因本体论,百科全书,槲皮素,山奈酚,豆甾醇,核心作用,PTGS2,COX,MAO,神经递质,巨细胞病毒感染,RAGE,中医药治疗
AB值：
0.285809
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