典型文献
小鼠Spata3蛋白结构和功能的生信分析及初鉴
文献摘要:
目的 对小鼠精子发生相关蛋白3(spermatogenesis associated protein 3,Spata3)的序列进行分析,探讨其结构和功能.方法 利用NCBI数据库比对小鼠Spata3的同源性、ExPASy ProtParam软件分析理化特征、SOPMA及GOR4预测空间构象、NetPhos3.1及STRING数据库分析蛋白修饰位点及蛋白间相互作用关系等信息、免疫组化和免疫荧光染色检测其组织细胞定位.结果 小鼠和人的Spata3基因CDS序列64%相同,是碱性不稳定亲水蛋白,无信号肽,属于非跨膜的胞内蛋白,主要定位于睾丸组织各级精子细胞核和胞质,以圆形精子细胞表达量最高.小鼠Spata3含1个内在无序区结构域,30个潜在的磷酸化位点,11个潜在的O-型糖基化位点,可能与Spata46、Spert等蛋白相互作用.结论 小鼠Spata3是精子发生过程中的保守蛋白,可能调节精子发生变形过程.
文献关键词:
Spata3;精子发生;生物信息学;蛋白质修饰位点;蛋白质相互作用
中图分类号:
作者姓名:
李美宁;马庆;弓韬;张引红;闫萍;翟翔;郭睿
作者机构:
山西医科大学生物化学与分子生物学教研室,出生缺陷与细胞再生山西省重点实验室,太原 030001;山西医科大学实验动物中心,实验动物与人类疾病动物模型山西省重点实验室,太原 030001
文献出处:
引用格式:
[1]李美宁;马庆;弓韬;张引红;闫萍;翟翔;郭睿-.小鼠Spata3蛋白结构和功能的生信分析及初鉴)[J].中国实验动物学报,2022(06):767-776
A类:
Spata3,GOR4,Spata46,Spert,蛋白质修饰位点
B类:
蛋白结构,结构和功能,生信分析,精子发生,spermatogenesis,associated,protein,NCBI,库比,同源性,ExPASy,ProtParam,理化特征,SOPMA,空间构象,NetPhos3,STRING,数据库分析,蛋白修饰,相互作用关系,免疫组化,免疫荧光染色,组织细胞,细胞定位,CDS,定亲,亲水,信号肽,睾丸组织,精子细胞,细胞核,结构域,磷酸化,糖基化位点,蛋白相互作用,变形过程,蛋白质相互作用
AB值:
0.346345
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