典型文献
伤寒沙门菌非编码RNA617的分子鉴定及其对生物膜形成的影响
文献摘要：
本研究旨在探讨伤寒沙门菌(Salmonella enterica serovar Typhi,S.Typhi)中非编码RNA617(non-coding RNA617,ncRNA617)的分子特性,并研究其对生物膜形成的影响及作用机制.采用Northern blot方法检测ncRNA617的表达,通过cDNA 5'末端快速扩增技术(5'-rapid amplification of cDNA end,5'RACE)和逆转录-聚合酶链式反应(reverse transcriotion-polymerase chain reaction,3'RT-PCR)实验分析ncRNA617可能的转录起始位点和终止位点;构建ncRNA617缺陷菌株、回补菌株和过表达菌株等相关菌株,通过生物膜形成实验,观察ncRNA617对伤寒沙门菌生物膜形成的影响,并用实时荧光定量聚合酶链式反应(quantitative real-time polymerase chain reaction,qPCR)分析生物膜形成相关基因表达水平的变化,综合运用生物信息学方法预测ncRNA617和差异基因的结合区域,初步分析ncRNA617发挥调控作用的机制.结果显示,伤寒沙门菌确有ncRNA617的表达,长度约300 nt,其转录起始位点位于mig-14终止密码子下游967 nt处,终止位点位于t2681起始密码子上游2378～2560 nt处.与野生对照菌株相比,ncRNA617缺陷菌株生物膜形成能力增强(P<0.05),回补菌株的生物膜形成能力恢复至野生菌株水平,过表达菌株的生物膜形成能力有所下降(P<0.05).qPCR结果表明,ncRNA617可负向调控多个生物膜形成相关基因的转录表达水平(P<0.05).经生物信息学方法预测发现,ncRNA617与差异基因有不同的结合区域.本研究结果提示,ncRNA617在伤寒沙门菌中存在,其长度约270～452 nt.ncRNA617可能通过靶向结合生物膜形成相关基因下调基因表达,从而负向调控伤寒沙门菌生物膜的生成.
文献关键词：
伤寒沙门菌;分子鉴定;非编码RNA;生物膜
中图分类号：
作者姓名：
靳梦彤;李雪;党娟娟;李泽宇;张盈;黄新祥
作者机构：
江苏大学医学院生物化学与分子生物学系,江苏镇江 212013;南通市第三人民医院检验科,江苏南通 226006
文献出处：
引用格式：
[1]靳梦彤;李雪;党娟娟;李泽宇;张盈;黄新祥-.伤寒沙门菌非编码RNA617的分子鉴定及其对生物膜形成的影响)[J].微生物与感染,2022(01):18-29
A类：
RNA617,serovar,Typhi,ncRNA617,transcriotion,mig,t2681
B类：
伤寒沙门菌,非编码,分子鉴定,生物膜形成,Salmonella,enterica,coding,分子特性,影响及作用,Northern,blot,cDNA,rapid,amplification,end,RACE,逆转录,reverse,polymerase,chain,reaction,转录起始位点,过表达,实时荧光定量聚合酶链式反应,quantitative,real,qPCR,相关基因表达,基因表达水平,生物信息学方法,差异基因,初步分析,确有,终止密码子,形成能,野生菌株,株水平,转录表达
AB值：
0.17678
相似文献
机标中图分类号，由域田数据科技根据网络公开资料自动分析生成，仅供学习研究参考。
