典型文献
一株脓液分离的海岸嗜半胱氨酸菌的鉴定及毒力基因分析
文献摘要：
目的:通过对1株从1名被海虾刺伤的患者脓液分离的致病菌株JM-1进行准确鉴定、药敏试验和毒力基因分析，为海岸嗜半胱氨酸菌( Cysteiniphilum litorale)作为罕见病原体引起临床相关感染的筛检及改善预后提供实验依据。 方法:对分离株进行生化表型鉴定、基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)鉴定、16S rRNA基因测序和系统发育分析，以及基于全基因组序列的平均核苷酸一致性(average nucleotide identity，ANI)、平均氨基酸一致性(average amino acid identity，AAI)分析和系统发育分析，以准确确定其分类学地位；以 E-test法进行药敏试验，并依据CLSI M45-A3土拉弗朗西斯菌解释标准进行结果判读；以VFDB毒力因子数据库对全基因组进行毒力基因注释和分析。 结果:分离株JM-1在哥伦比亚血平板上培养3 d可见灰白色、中等大小、光滑、圆形、凸起的溶血菌落。革兰染色为着色较淡的阴性球杆菌。API NH鉴定结果提示为卡他莫拉菌(生化编码：3010)；Vitek2系统NH卡鉴定无鉴定结果(生物编码：0211002121)。EXS3000质谱仪自建库数据库鉴定为海岸嗜半胱氨酸菌。基于16S rRNA基因和全基因组的系统发育分析均表明该菌株与海岸嗜半胱氨酸菌DSM 101832 T聚类为同一个小的分支，且两者之间的全基因组ANI和AAI值分别为95.07%和95.65%。药敏试验显示分离株JM-1产β-内酰胺酶和青霉素酶，对青霉素耐药，对庆大霉素、链霉素、强力霉素、四环素、环丙沙星、左氧氟沙星、氯霉素敏感。从分离株JM-1基因组注释到了与弗朗西斯菌相似的毒力基因：弗朗西斯菌致病岛(FPI)、Ⅳ型菌毛、荚膜和脂多糖等。 结论:海岸嗜半胱氨酸菌是一种具有弗朗西斯菌毒力相关基因罕见病原体，且其药敏特性亦与弗朗西斯菌相类似。本案例确认了一例由海岸嗜半胱氨酸菌引起的临床感染，自建库的MALDI-TOF质谱系统可用于其快速鉴定。
文献关键词：
海岸嗜半胱氨酸菌;分类鉴定;药敏;毒力基因
中图分类号：
作者姓名：
冯俊慧;钟一梅;赵婵静;李月桂;陈富;陈茶;屈平华
作者机构：
广州中医药大学第二临床医学院，广州 510006;江门市五邑中医院检验科，江门 529000;广东省中医院检验医学部，广州 510006;广州市番禺区健康管理中心，广州 511490
文献出处：
引用格式：
[1]冯俊慧;钟一梅;赵婵静;李月桂;陈富;陈茶;屈平华-.一株脓液分离的海岸嗜半胱氨酸菌的鉴定及毒力基因分析)[J].中华微生物学和免疫学杂志,2022(04):258-264
A类：
海岸嗜半胱氨酸菌,Cysteiniphilum,litorale,EXS3000,101832
B类：
一株,脓液,毒力基因,基因分析,海虾,刺伤,致病菌,JM,药敏试验,罕见病,病原体,临床相,筛检,分离株,表型鉴定,基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱,MALDI,TOF,16S,rRNA,基因测序,系统发育分析,全基因组序列,平均核苷酸一致性,average,nucleotide,identity,ANI,amino,acid,AAI,分类学地位,test,CLSI,M45,A3,拉弗朗,弗朗西斯菌,解释标准,结果判读,VFDB,毒力因子,基因注释,哥伦比亚,灰白色,凸起,溶血,菌落,革兰染色,为着,着色,球杆,API,NH,卡他莫拉菌,Vitek2,质谱仪,自建库,DSM,同一个,内酰胺酶,青霉素,庆大霉素,链霉素,强力霉素,四环素,环丙沙星,左氧氟沙星,氯霉素,基因组注释,菌相,FPI,菌毛,荚膜,脂多糖,毒力相关基因,药敏特性,相类,本案,一例,临床感染,快速鉴定,分类鉴定
AB值：
0.329934
机标中图分类号，由域田数据科技根据网络公开资料自动分析生成，仅供学习研究参考。
