典型文献
1株同时携带vanA、vanM的屎肠球菌高通量测序分析
文献摘要:
目的 了解耐万古霉素屎肠球菌EFM277的耐药基因分布特点及机制.方法 用Illumina Hiseq平台对EFM277进行高通量测序,用生物信息学技术对数据进行拼接和分析.结果 对耐万古霉素屎肠球菌测序数据进行分析,发现编码氨基糖苷类耐药基因包括aac(6′)?Ii、aph(3′)?Ⅲ、aac(6′)?aph(2″);四环素耐药基因tetM;大环内酯类耐药基因包括msrC、ermB;同时检出糖肽类耐药基因vanA、vanM,较为罕见.多位点序列分型(MLST)分析发现其可能是一种新的ST型,与ST17型最相近.毒力基因分析中发现其携带acm、esp、hyl 3种毒力基因.结论 利用高通量测序技术阐明EFM277耐药机制,为临床用药提供更为有力的依据.
文献关键词:
屎肠球菌;耐万古霉素肠球菌;高通量测序;vanA;vanM
中图分类号:
作者姓名:
徐倩;陈定强
作者机构:
广州中医药大学第一附属医院检验科,广州510410;南方医科大学珠江医院检验科,广州510280
文献出处:
引用格式:
[1]徐倩;陈定强-.1株同时携带vanA、vanM的屎肠球菌高通量测序分析)[J].临床检验杂志,2022(05):351-354
A类:
vanA,vanM,EFM277,msrC,acm
B类:
高通量测序分析,耐万古霉素屎肠球菌,基因分布,Illumina,Hiseq,生物信息学技术,拼接,序数,氨基糖苷类,aac,Ii,aph,四环素耐药基因,tetM,大环内酯类耐药基因,ermB,糖肽,肽类,多位点序列分型,MLST,ST17,毒力基因,基因分析,esp,hyl,高通量测序技术,耐药机制,临床用药,耐万古霉素肠球菌
AB值:
0.295337
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