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mNGS检测革兰阳性菌耐药基因的临床应用
文献摘要：
目的 探讨宏基因组高通量测序(mNGS)检测革兰阳性菌耐药基因的临床应用.方法 收集2021年4月1日—2022年4月1日南京医科大学第一附属医院呼吸与危重症医学科收治的249例呼吸道感染患者肺泡灌洗液标本微生物培养和mNGS检测结果,并进行革兰阳性菌耐药表型和抗菌药物耐药基因(ARGs)分析.结果 249份肺泡灌洗液标本通过mNGS检测到10种革兰阳性菌,以肺炎链球菌、假肺炎链球菌和金黄色葡萄球菌为主;检出携带ARGs的革兰阳性菌4种,金黄色葡萄球菌ARGs有blaZ、mecA、mecR1、aac(6')-Ie-aph(2'')-Ia、ant(9)-Ia、tet(K)、tet(L);粪肠球菌ARGs有tet(M)、dfr(E);屎肠球菌ARGs有tet(M);肺炎链球菌ARGs有tet(M).在3株携带ARGs的金黄色葡萄球菌中,青霉素耐药基因blaZ、甲氧西林耐药基因mecA、氨基糖苷类抗生素耐药基因aac(6')-Ie-aph(2'')-Ia可较好地预测耐药表型,四环素耐药基因tet(L)预测的耐药表型与传统药敏培养结果一致性较差.结论 mNGS可检测出革兰阳性菌中ARGs,主要检出ARGs的革兰阳性菌有金黄色葡萄球菌、肺炎链球菌、屎肠球菌和粪肠球菌;金黄色葡萄球菌中检测到的耐药基因blaZ、mecA、aac(6')-Ie-aph(2'')-Ia可较好地预测耐药表型.mNGS检测ARGs预测耐药表型有一定临床应用价值.
文献关键词：
肺泡灌洗液;宏基因组高通量测序;革兰阳性菌;抗菌药物耐药基因;预测
中图分类号：
作者姓名：
张群;王明月;钱倩;戴山林;孙文逵
作者机构：
南京医科大学第一附属医院呼吸与危重症医学科,江苏南京210029;江苏卫生健康职业学院,江苏南京211800
文献出处：
引用格式：
[1]张群;王明月;钱倩;戴山林;孙文逵-.mNGS检测革兰阳性菌耐药基因的临床应用)[J].中华医院感染学杂志,2022(18):2721-2724
A类：
抗菌药物耐药基因,mecR1,dfr
B类：
mNGS,革兰阳性菌,宏基因组高通量测序,日南,南京医科大学,呼吸与危重症医学科,呼吸道感染,感染患者,肺泡灌洗液,微生物培养,耐药表型,ARGs,肺炎链球菌,金黄色葡萄球菌,blaZ,mecA,aac,Ie,aph,Ia,ant,tet,粪肠球菌,屎肠球菌,青霉素,西林,氨基糖苷类抗生素,抗生素耐药基因,四环素耐药基因,药敏,结果一致性,临床应用价值
AB值：
0.154283
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