典型文献
基于网络药理学探讨地黄治疗糖尿病肾病合并抑郁症的作用机制
文献摘要:
目的 基于网络药理学预测地黄治疗糖尿病肾病合并抑郁症的分子作用机制.方法 利用中医药整合药理学研究平台(TCMIP)和中药系统药理学数据库和分析平台(TCMSP)以及文献检索地黄活性成分,结合SwissTargetPrediction、PubChem数据库查找成分靶点;以"糖尿病肾病""抑郁症"为关键词在治疗目标数据库(TTD)、DisGeNET和Ensembl数据库搜集疾病靶点,使用Venny 2.1.0对疾病-成分靶点进行映射得到潜在靶点;利用基因/蛋白相互作用检索搜查工具(STRING)数据库结合Cytoscape 3.7.2构建蛋白质相互作用(PPI)网络,基于COXPRESdb 7.3数据库搜集关键靶点共表达基因;运用R语言对潜在靶点进行基因本体论(GO)与京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析.采用Discovery Studio 4.5对靶点-成分对接实现初步验证和评估.结果 根据数据库及文献报道,地黄含65种有效化学成分,治疗糖尿病肾病合并抑郁症的相关靶点155个,PPI筛选显示关键靶点有丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶1(AKT1)、信号传导与转录激活因子3(STAT3)、白细胞介素-6(IL-6)、丝裂原活化蛋白激酶1(MAPK1)和血管内皮生长因子A(VEGFA)等.GO富集分析主要涉及血脂代谢、蛋白质分泌调节、细胞体内稳态和磷脂酰肌醇3激酶活性等生物过程;KEGG通路富集分析涉及AGE-RAGE信号通路在糖尿病合并症中的作用、胰岛素抵抗(IR)、神经营养因子信号通路、Toll样受体信号通路、松弛素信号通路和表皮生长因子受体酪氨酸激酶抑制剂(EGFR-TKIs)等.分子对接显示靶点与水苏糖、甘露三糖、毛蕊花糖和黑曲霉二糖等成分具有较高亲和力.结论 通过网络构建分析,地黄可能通过调控炎症的发生、调节血糖代谢和营养神经等通路治疗糖尿病肾病合并抑郁症.
文献关键词:
地黄;糖尿病肾病;抑郁症;网络药理学;分子对接;异病同治;本虚标实;炎症
中图分类号:
作者姓名:
雷星;陈青垚;王小平;徐杰;高亚珍;林巧红;叶祖文;ZHANG Jieyan;SI Qin;王芳
作者机构:
江西中医药大学现代中药制剂教育部重点实验室,江西 南昌 330004,中国;漳州卫生职业学院药学系,福建 漳州 363000,中国;School of Agro-Industry,Mae Fah Luang University,Muang,Chiang Rai 57100,Thailand
文献出处:
引用格式:
[1]雷星;陈青垚;王小平;徐杰;高亚珍;林巧红;叶祖文;ZHANG Jieyan;SI Qin;王芳-.基于网络药理学探讨地黄治疗糖尿病肾病合并抑郁症的作用机制)[J].数字中医药(英文),2022(02):178-188
A类:
COXPRESdb,甘露三糖
B类:
地黄,治疗糖尿病肾病,抑郁症,网络药理学预测,测地,分子作用机制,整合药理学,药理学研究,研究平台,TCMIP,系统药理学,分析平台,TCMSP,文献检索,活性成分,SwissTargetPrediction,PubChem,治疗目标,TTD,DisGeNET,Ensembl,Venny,潜在靶点,蛋白相互作用,搜查,STRING,Cytoscape,蛋白质相互作用,PPI,关键靶点,共表达基因,基因本体论,京都基因与基因组百科全书,Discovery,Studio,对靶,有效化学成分,丝氨酸,苏氨酸蛋白激酶,AKT1,信号传导,转录激活因子,STAT3,丝裂原活化蛋白激酶,MAPK1,血管内皮生长因子,VEGFA,血脂代谢,蛋白质分泌,细胞体,内稳态,磷脂酰肌醇,激酶活性,生物过程,通路富集分析,RAGE,糖尿病合并症,胰岛素抵抗,神经营养因子,Toll,样受体,松弛素信号通路,表皮生长因子受体酪氨酸激酶抑制剂,EGFR,TKIs,分子对接,水苏糖,花糖,黑曲霉,二糖,亲和力,网络构建,构建分析,血糖代谢,养神,异病同治,本虚标实
AB值:
0.345617
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