典型文献
肺癌患者血浆外泌体microRNAs标志物的筛选
文献摘要:
目的:筛选肺癌患者血浆外泌体中的异常microRNA(miRNA),以期为肺癌筛查及辅助诊断提供新的标志物和方向.方法:选择6名肺癌患者(腺癌3例、鳞癌2例,小细胞肺癌1例)和4名健康对照者血浆样本,采用差速离心法提取血浆外泌体,采用Agilent Bioanalyzer对抽提的RNA进行质量检验,对血浆外泌体miRNA进行高通量测序分析,采用TargetScan、PITA和miRNAorg数据库进行靶基因预测,应用R软件进行靶基因的KEGG和GO分析.结果:miRNA表达分析发现,与正常对照者比较,肺癌患者血浆外泌体中有142种miRNAs表达异常,其中62种miRNAs表达上调,80种miRNAs表达下调.GO分析显示,这些miRNAs的靶基因主要参与了以DNA为模板的转录、转录调控及信号转导等.KEGG分析显示,这些miRNAs的靶基因主要参与轴突导向信号通路、钙信号通路、肌动蛋白细胞骨架调节等.结论:通过对肺癌患者和健康对照者血浆外泌体miRNAs进行高通量测序,初步筛选出差异表达miRNA,经生物信息学分析,推测其对肺癌转移具有良好预测潜力,有望成为肺癌筛查和辅助诊断的候选生物标志物.
文献关键词:
肺癌;筛查;外泌体;肿瘤标志物;微小RNA
中图分类号:
作者姓名:
刘霞;高孜博;丁丽华;吴拥军
作者机构:
郑州大学公共卫生学院,河南 郑州 450001
文献出处:
引用格式:
[1]刘霞;高孜博;丁丽华;吴拥军-.肺癌患者血浆外泌体microRNAs标志物的筛选)[J].癌变·畸变·突变,2022(06):407-412,420
A类:
Bioanalyzer,PITA,miRNAorg
B类:
肺癌患者,血浆外泌体,microRNAs,肺癌筛查,辅助诊断,鳞癌,小细胞肺癌,差速离心,离心法,Agilent,抽提,质量检验,高通量测序分析,TargetScan,靶基因预测,表达分析,正常对照,miRNAs,转录调控,信号转导,轴突导向,钙信号通路,肌动蛋白,细胞骨架,初步筛选,出差,差异表达,生物信息学分析,肺癌转移,生物标志物,肿瘤标志物
AB值:
0.261552
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