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基于miRNA-mRNA探讨西黄丸干预乳腺癌骨转移的分子机制及预后分析
文献摘要：
目的 基于miRNA-mRNA互作模式,明晰西黄丸干预乳腺癌骨转移的分子机制并进行预后分析,为乳腺癌骨转移的药物干预靶点及生物标志物的确定提供理论依据.方法 综合GEO、TCGA、TargetScan、GeneCards、OMIM、TCMSP、STRING、HPA数据库,采用R语言及Cytoscape软件对西黄丸干预乳腺癌骨转移的分子靶点进行miRNA-mRNA互作关系构建;蛋白质-蛋白质相互作用(protein-protein interaction,PPI)及Hub基因拓扑分析;基因本体论(gene ontology,GO)和京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)富集分析.进一步使用TCGA数据库,分析肿瘤组织与正常组织分子靶点的差异表达,并通过HPA数据库进行免疫组化结果的相互佐证.最后结合患者临床信息,分析Lasso回归后分子靶点的预后相关性,单因素Cox回归分析临床信息与分子靶点预后情况,并开发乳腺癌骨转移的风险预测模型.结果 西黄丸中的多种成分可作用于乳腺癌骨转移135个分子靶点,与196个乳腺癌骨转移差异miRNA构建出2964组miRNA-mRNA互作关系,锚定了10个Hub基因与95个miRNA,构建出175组miRNA-mRNA核心关系.Lasso回归聚焦出ADRB1是乳腺癌骨转移患者的独立预后因子,具有良好的诊断价值及生存预后价值,Cox回归分析发现乳腺癌的M分期、年龄是主要危险因素,而ADRB1高表达为保护因素,三者与患者总生存时间显著相关.基于8个miRNA(hsa-miR-500a-5p、hsa-miR-629-3p、hsa-miR-4665-5p、hsa-miR-3615、hsa-let-7d-5p、hsa-miR-93-3p、hsa-miR-141-3p、hsa-miR-183-3p)开发预后模型,以评估乳腺癌骨转移的预后.结论 本研究阐述了西黄丸干预乳腺癌骨转移的分子机制.其机制与其多组分调控ADRB1等多靶点,参与多生命进程有关,以miRNA-mRNA互作模式共同调控乳腺癌骨转移不良预后.本研究还建立了乳腺癌骨转移预测模型,为开发治疗乳腺癌骨转移药物以及乳腺癌骨转移生物标志物的确定提供了潜在价值.
文献关键词：
乳腺癌;骨转移;西黄丸;生物信息学;网络药理学;列线图
中图分类号：
作者姓名：
邓显光;刘丽芳;袁博
作者机构：
湖南中医药大学第一附属医院乳腺科,湖南 长沙 410007
文献出处：
引用格式：
[1]邓显光;刘丽芳;袁博-.基于miRNA-mRNA探讨西黄丸干预乳腺癌骨转移的分子机制及预后分析)[J].湖南中医药大学学报,2022(12):2043-2051
A类：
B类：
miRNA,西黄丸,乳腺癌骨转移,预后分析,药物干预,干预靶点,生物标志物,GEO,TCGA,TargetScan,GeneCards,OMIM,TCMSP,STRING,HPA,言及,Cytoscape,分子靶点,互作关系,关系构建,蛋白质相互作用,protein,interaction,PPI,Hub,拓扑分析,基因本体论,ontology,京都基因与基因组百科全书,Kyoto,encyclopedia,genes,genomes,富集分析,肿瘤组织,正常组织,差异表达,免疫组化,佐证,临床信息,Lasso,预后相关性,Cox,预后情况,发乳,风险预测模型,锚定,ADRB1,预后因子,诊断价值,生存预后,预后价值,保护因素,总生存时间,hsa,500a,5p,3p,let,7d,预后模型,多组分,组分调控,多靶点,多生,生命进程,同调,不良预后,转移预测,潜在价值,网络药理学,列线图
AB值：
0.290649
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