典型文献
17种毛茛科藏药材的分子鉴别
文献摘要：
目的 毛茛科的多种植物是民族药的基原,本研究以ITS2序列作为DNA条形码对17种毛茛科藏药材进行鉴定,为药材的安全使用提供可靠的检测方法.方法 从四个省份采集或购买17种毛茛科藏药材样本,分布于8个属.采用试剂盒法提取基因组DNA,PCR扩增ITS2序列后,将扩增产物进行双向测序.利用CodonCode Aligner(v.9.0.1)软件进行序列拼接,将拼接后的序列在NCBI网站进行在线比对.在GenBank数据库中下载相关物种的rDNA序列(包含完整的ITS2区域).上述序列经过CodonCode Aligner(v.9.0.1)软件剪切后,采用BLAST方法进行比对,然后再采用两种方法评估ITS2序列的鉴定能力.第一种是系统聚类树法(Tree-based method),用MEGA(v.5.0)软件构建NJ系统聚类树(Neighbour-Joining tree);第二种是遗传距离法(Distance-based method),用TaxonGap(v.2.4.1)软件分析物种的种内与种间变异关系.结果 29份试验样本的ITS2序列测序成功率为100％,与93条数据库中下载的ITS2序列合并后,长度为213-230 bp,比对长度为244 bp,变异位点数72.1％.BLAST结果表明,29条ITS2序列可以将全部物种鉴定到属.系统聚类分析结果表明,ITS2序列能够成功鉴别8种药材;遗传距离分析结果表明,ITS2序列能够成功鉴别7种毛茛科药材.两种方法总共可以鉴别9种药材,它们是露蕊乌头(Aconitum gymnandrum)、草玉梅(Anemone rivularis)、多小叶升麻(Cimicifuga foetida var.foliolosa)、短尾铁线莲(Clematis brevicaudata)、长花铁线莲(Clematis rehderiana)、甘青铁线莲(Clematis tangutica)、腺毛黑种草(Nigella glandulifera)、拟耧斗菜(Paraquilegia microphylla)和芸香叶唐松草(Thalictrum rutifolium),鉴定效率为52.9％.结论 ITS2序列可以快速、准确地识别和鉴定部分毛茛科藏药材,为原植物和药材的分子鉴定提供依据.
文献关键词：
毛茛科;ITS2序列;DNA条形码;分子鉴定
中图分类号：
作者姓名：
慕泽泾;吴晓鑫;游茜茜;杜小浪;钟国跃;王晓云
作者机构：
江西中医药大学中药资源与民族药研究中心 南昌 330004
文献出处：
引用格式：
[1]慕泽泾;吴晓鑫;游茜茜;杜小浪;钟国跃;王晓云-.17种毛茛科藏药材的分子鉴别)[J].世界科学技术-中医药现代化,2022(07):2594-2601
A类：
Neighbour,TaxonGap,gymnandrum,Cimicifuga,foetida,foliolosa,brevicaudata,rehderiana,甘青铁线莲,tangutica,glandulifera,Paraquilegia,rutifolium
B类：
毛茛科,藏药材,分子鉴别,民族药,基原,ITS2,列作,条形码,安全使用,试剂盒法,扩增产物,CodonCode,Aligner,拼接,NCBI,GenBank,下载,rDNA,BLAST,方法评估,鉴定能力,第一种,Tree,method,MEGA,软件构建,NJ,Joining,tree,第二种,遗传距离,Distance,种内,种间变异,试验样本,条数据,bp,变异位点,物种鉴定,系统聚类分析,能够成功,总共,乌头,Aconitum,Anemone,rivularis,小叶,升麻,var,短尾铁线莲,Clematis,花铁,腺毛,黑种,种草,Nigella,耧斗菜,microphylla,芸香,香叶,Thalictrum,分子鉴定
AB值：
0.355305
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