典型文献
熊本牡蛎、葡萄牙牡蛎和长牡蛎组织菌群构成及功能的比较分析
文献摘要：
为探究健康二龄熊本牡蛎、葡萄牙牡蛎和长牡蛎5种组织间细菌群落组成、多样性和功能的差异,本研究利用Illumina高通量测序技术和PICRUSt2对3种牡蛎5种组织中的细菌群落构成及其潜在功能进行了比较分析.结果显示,在3种牡蛎的5种组织中共鉴定到6020个细菌OTUs,其中3种牡蛎整体间共有的OTUs数占42.4％.3种牡蛎5种组织中的优势菌主要隶属于γ-变形菌纲(γ-pro-teobacteria)、α-变形菌纲(α-proteobacteria)、柔壁菌门(Tenericutes)和厚壁菌门(Firmicutes).弧菌属(Vibrio)在熊本牡蛎的鳃、外套膜、性腺和血淋巴中的相对丰度均显著高于长牡蛎和葡萄牙牡蛎,且分别在熊本牡蛎外套膜、长牡蛎性腺和葡萄牙牡蛎血淋巴中相对丰度最高,但均在3种牡蛎肝胰腺中相对丰度最低.3种牡蛎5种组织间的菌群多样性均有所差异,其中在熊本牡蛎鳃、葡萄牙牡蛎外套膜和长牡蛎血淋巴中菌群多样性最高,而在熊本牡蛎血淋巴、葡萄牙牡蛎性腺和长牡蛎肝胰腺中菌群多样性最低.在不区分组织的情况下,3种牡蛎整体间的菌群结构存在显著差异(r=0.661,p<0.001).此外,在熊本牡蛎肝胰腺、葡萄牙牡蛎鳃和长牡蛎血淋巴中细菌参与的能量代谢相关功能通路的相关丰度显著高于对应牡蛎的其他组织.本文结果表明,熊本牡蛎、葡萄牙牡蛎和长牡蛎组织内的菌群构成存在差异,且由细菌介导的功能也随牡蛎种类和组织类型发生改变.
文献关键词：
牡蛎;高通量测序;细菌群落;功能预测
中图分类号：
作者姓名：
叶静;戴文芳;刘圣;林志华;薛清刚
作者机构：
上海海洋大学 水产科学国家级实验教学示范中心,上海 201306;浙江万里学院 生物与环境学院 浙江省水产种质资源高效利用技术研究重点实验室,浙江 宁波 315100;浙江万里学院 宁海海洋生物种业研究院,浙江 宁海 315604
文献出处：
引用格式：
[1]叶静;戴文芳;刘圣;林志华;薛清刚-.熊本牡蛎、葡萄牙牡蛎和长牡蛎组织菌群构成及功能的比较分析)[J].海洋学报（中文版）,2022(08):66-77
A类：
proteobacteria
B类：
熊本,葡萄牙,长牡蛎,菌群构成,细菌群落组成,研究利用,Illumina,高通量测序技术,PICRUSt2,群落构成,OTUs,数占,优势菌,隶属于,Tenericutes,和厚壁,厚壁菌门,Firmicutes,弧菌,Vibrio,外套膜,性腺,血淋巴,巴中,相对丰度,肝胰腺,菌群多样性,菌群结构,能量代谢,相关功能,他组织,组织类型,功能预测
AB值：
0.206451
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