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典型文献
南海岛礁海域金带齿颌鲷鳃组织和肠道菌群结构及其肠道菌群对碳源的利用特征
文献摘要:
为比较南海岛礁海域金带齿颌鲷(Gnathodentex aurolineatus)鳃组织和肠道菌群结构及其肠道菌群对碳源的利用特征,从南海3个岛礁海域采集优势岛礁鱼类——金带齿颌鲷的鳃组织和肠道样品,采用高通量测序技术分析其细菌群落结构组成,利用Biolog Eco微板法分析可培养肠道微生物的碳代谢功能.结果显示,各海域金带齿颌鲷鳃组织和肠道样品微生物菌群存在较高相似性,但门和属水平相对丰度存在显著差异.所有样品共有可操作分类单元(operational taxonomic unit,OTU)数为151个,其中永暑礁肠道样品的OTU数高达1022个,琛航岛肠道样品OTU数仅492个;门水平上,鳃组织和肠道样品共有的优势菌均为变形菌门(Proteobacteria)、拟杆菌门(Bacteroidetes)、厚壁菌门(Firmicutes),特有的优势菌为放线菌门(Actinobacteria)和梭杆菌门(Fusobacteria);属水平上,鳃组织共有优势属为埃希氏-志贺氏菌属(Escherichia-Shigella)、拟杆菌属(Bacteroide)、双歧杆菌属(Bifidobacterium)、考拉杆菌属(Phascolarctobacterium)、发光杆菌属(Photobacterium)、Marispirillum 属、Pandoraea属;肠道样品中共有优势属为埃希氏-志贺氏菌属和拟杆菌属,其他优势属存在显著差异.肠道菌群的代谢活性和对氨基酸、糖类、脂类3类碳源的利用率由高到低均为渚碧礁组(ZB)、永暑礁组(YS)、琛航岛组(CH),3组间差异显著(P<0.05);功能预测结果显示代谢类相关功能基因所占比例高,对3类碳源的利用与可培养菌群碳源利用规律一致.研究表明,金带齿颌鲷肠道微生物菌群具有较高的碳源代谢能力,后续可尝试从肠道微生物中挖掘高产酶菌株.
文献关键词:
金带齿颌鲷;菌群结构;碳源利用;岛礁海域
作者姓名:
王晶晶;胡晓娟;曹煜成;苏浩昌;文国樑;张月星
作者机构:
浙江海洋大学国家海洋设施养殖工程技术研究中心,浙江舟山316022;中国水产科学研究院南海水产研究所,农业农村部南海渔业资源开发利用重点实验室,广东省渔业生态环境重点实验室,广东广州510300
文献出处:
引用格式:
[1]王晶晶;胡晓娟;曹煜成;苏浩昌;文国樑;张月星-.南海岛礁海域金带齿颌鲷鳃组织和肠道菌群结构及其肠道菌群对碳源的利用特征)[J].中国水产科学,2022(12):1788-1799
A类:
金带齿颌鲷,Gnathodentex,aurolineatus,琛航岛,Marispirillum,Pandoraea
B类:
南海岛礁,岛礁海域,肠道菌群结构,鱼类,高通量测序技术,细菌群落结构,结构组成,Biolog,Eco,微板法,碳代谢,代谢功能,相对丰度,有样,操作分类单元,operational,taxonomic,unit,OTU,永暑礁,优势菌,变形菌门,Proteobacteria,拟杆菌门,Bacteroidetes,厚壁菌门,Firmicutes,放线菌,Actinobacteria,梭杆菌,Fusobacteria,优势属,埃希氏,志贺氏菌,Escherichia,Shigella,拟杆菌属,双歧杆菌属,Bifidobacterium,考拉,拉杆,Phascolarctobacterium,发光杆菌,Photobacterium,代谢活性,糖类,脂类,ZB,YS,CH,功能预测,相关功能,功能基因,可培养菌,碳源利用,利用规律,肠道微生物菌群,碳源代谢,代谢能,产酶菌株
AB值:
0.338668
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