典型文献
组蛋白去乙酰化酶SIRT1对胰腺癌代谢的调控作用
文献摘要:
目的 通过代谢组学和转录组学技术,探讨组蛋白去乙酰化酶SIRT1对胰腺癌代谢的调控作用及其作用机制.方法 分析TCGA、GTEx和HPA等数据库中胰腺癌和正常组织的数据,鉴定SIRT1的表达.构建6组SIRT1稳定敲减和对照的胰腺癌PANC-1细胞系,分别应用UHPLC-MS/MS和高通量RNA-seq技术测量代谢物和基因表达水平.探索差异代谢物参与的代谢通路及与药物反应性和耐药性的关系.结果 TCGA和GTEx数据分析发现,SIRT1在胰腺癌中的表达显著高于正常组织;HPA数据库进一步证实了SIRT1蛋白的高表达.非靶向代谢组检测和高通量转录组测序分别鉴定出59个代谢物和688个基因的差异有统计学意义.差异代谢物主要富集在癌症中胆碱的代谢、嘧啶代谢、ABC转运等代谢通路.有14个显著差异的基因参与了SIRT1调控的代谢通路.这些基因主要富集在嘌呤代谢信号通路,参与ATP结合和小分子代谢等生物过程.CARE分析显示,SIRT1高表达会促使大量抗肿瘤药物出现高反应性,同时也会使部分药物出现耐药性.结论 SIRT1对胰腺癌代谢有调控作用,为SIRT1参与胰腺癌代谢的调控机制研究和胰腺癌的靶向治疗奠定了基础.
文献关键词:
沉默信息调节因子2相关酶1;胰腺癌;代谢组学;转录组学;调控机制
中图分类号:
作者姓名:
苑宝文;王沛;黄蔚
作者机构:
国家癌症中心 国家肿瘤临床医学研究中心 中国医学科学院北京协和医学院肿瘤医院分子肿瘤学国家重点实验室,中国医学科学院恶性肿瘤与微生物组学重点实验室,北京100021;肿瘤侵袭和转移机制研究北京市重点实验室,首都医科大学基础医学院生物化学与分子生物学系,北京100069;首都医科大学附属北京友谊医院,国家消化系统疾病临床医学研究中心,北京100050
文献出处:
引用格式:
[1]苑宝文;王沛;黄蔚-.组蛋白去乙酰化酶SIRT1对胰腺癌代谢的调控作用)[J].山东大学学报(医学版),2022(03):1-12
A类:
B类:
组蛋白去乙酰化酶,SIRT1,胰腺癌,代谢组学,转录组学,组学技术,TCGA,GTEx,HPA,正常组织,敲减,PANC,细胞系,UHPLC,seq,基因表达水平,差异代谢物,代谢通路,药物反应性,耐药性,非靶向代谢组,高通量转录组测序,胆碱,嘧啶,ABC,嘌呤代谢,ATP,小分子,分子代谢,生物过程,CARE,抗肿瘤药物,调控机制,靶向治疗,沉默信息调节因子
AB值:
0.243553
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